Characterization of <i>Micrococcus luteus</i> Lipidome Containing Novel Lipid Families by Multiple Stage Linear Ion-Trap with High Resolution Mass Spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
Micrococcus luteus ( M. luteus ) is a ubiquitous, long-existing Gram-positive bacterium with a distinctive yellow or golden color. It is a model organism for laboratory studies due to its small genome and ease of cultivation. However, only limited knowledge about its constituent lipid structure is known, and its entire lipid profile remains unclear. Here, we applied linear ion trap (LIT) multiple-stage mass spectrometry (MS n ) with high resolution for structural characterization of the native lipid extract, along with GC/MS analysis of the acid hydrolysate to reveal the structural details of the entire lipidome, which includes the major phosphatidylglycerol (PG), cardiolipin (CL), phosphatidylinositol (PI), dimannosyl diacylglycerol (DMDG), and minor diacylglycerol (DAG) lipid families. Importantly, we also found two extra lipid families, the new phosphatidyl 1,3-propanediol and the known polyprenyl 1-phosphosate that was not previously reported for M. luteus . We also revealed the unique lipidome simplified by the dominance of branched 15:0-fatty acid substituents (>90% branched 15:0-FA with anteiso-15:0 to iso-15:0 abundance ratio of 4/1), which is in line with the small genome of M. luteus . In addition, the applied LIT MS n mass spectrometry revealed a fragmentation pathway that undergoes internal loss of a glycerol residue specific to DMDG, leading to its structural characterization.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».