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Enregistrement W4413915496 · doi:10.1096/fj.202501440r

Integrative Genomics and Phenotypic Profiling Reveal <i>Lacticplantibacillus plantarum</i> <scp>BGI</scp> ‐ <scp>N6</scp> as a Multifunctional Candidate for Dermatological Probiotic Development

2025· article· en· W4413915496 sur OpenAlexaff
Xiaowei Xu, Benliang Wei, Jake Y. Chen, Mengmeng Wang, Zhinan Wu, Yanhong Liu, Haifeng Zhang, Yiyi Zhong, Yuanqiang Zou

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensMD Precision (Canada)
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China-Guangdong Joint Fund
Mots-clésProbioticLactobacillus plantarumComputational biologyBiologyBiochemistryChemistryLactic acidBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Probiotics and postbiotics are recognized for their potential to benefit skin health, and complete genome analysis serves as a pivotal tool to accelerate the exploration of probiotic functionalities. To investigate this relationship, this study aimed to elucidate the skin-promoting potential of Lactiplantibacillus plantarum BGI-N6 (BGI-N6) through integrated genomic analysis and phenotypic analysis. Results indicated that the high-precision complete genome of BGI-N6 comprises 3 257 641 bases with a 45% GC content and 3030 CDSs, involving multiple genes related to carbon source fermentation, gastrointestinal tolerance, and environmental adaptability. Notably, BGI-N6 possessed several bacteriostatic, antioxidant, and enzyme activity inhibition-related genes, which could encode the biosynthetic pathways of bacteriocins, glutathione/thioredoxin antioxidant systems, NADH peroxidase, catalase, and various organic acids. Supporting these genomic insights, in vitro experiments comparative evaluation revealed that BGI-N6 exhibited superior capabilities relative to Lactiplantibacillus plantarum 299v (299v) in antioxidant activity, inhibition of cutaneous pathogens growth, and suppression of skin-damaging enzyme (e.g., collagenase and elastase) activity. These effects were correlated with the production of lactic acid, 6-hydroxyhexanoate, coumarins, and other bioactive compounds by BGI-N6. The evidence from integrated genomic analysis and in vitro experiments established a critical theoretical foundation for the development of BGI-N6 as a candidate for probiotic and postbiotic applications targeting skin health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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