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Enregistrement W4413930576 · doi:10.1038/s44298-025-00149-2

Distinct circulating autoantibodies are associated with COVID-19 hospitalization and SARS-CoV-2 neutralization activity

2025· article· en· W4413930576 sur OpenAlexafffund
Rajesh Abraham Jacob, Hannah O. Ajoge, Michael R. D’Agostino, Altynay Shigayeva, Arinjay Banerjee, Matthew S. Miller, Allison McGeer, Samira Mubareka, Karen Mossman

Notice bibliographique

Revuenpj Viruses · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensSinai Health SystemSunnybrook HospitalUniversity of TorontoMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAutoantibodyNeutralizationImmunologyAntibodyAntigenImmune systemVirologyMedicineSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)SerologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Internal medicineDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SARS-CoV-2 infection disrupts the host's immune system, altering autoimmune responses. This study investigated host autoreactivities in SARS-CoV-2 infections, their association with severe COVID-19, and the neutralizing antibody response. Circulating autoantibodies were detected in convalescent serum samples from unvaccinated SARS-CoV-2-infected patients. Clustering, correlation analysis, principal component analysis, and neural network modeling were used to explore the relationship between autoantibodies, hospitalization, and SARS-CoV-2 neutralization. The presence of one autoantibody correlated with the detection of multiple others. Anti-IFNα antibodies were associated with elevated levels of anti-ENAs (extractable-nuclear antigen) but not with clinical outcome. COVID-19 hospitalization was significantly associated with the collective expression of autoantibodies targeting three ENAs: SSA/Ro52, Jo-1, and RNP. In contrast, autoantibodies targeting RNP/Sm, PCNA, Scl-70, and PL-12 were strongly associated with SARS-CoV-2 neutralization. In summary, this study has identified self-antigens targeted in hospitalized COVID-19 patients and highlights a novel association between the autoantibody response and the antiviral humoral response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,384
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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