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Enregistrement W4413948581 · doi:10.26434/chemrxiv-2025-wd80w

LightChem: A Lightweight Domain-Specific Language Model for Molecular Property and Reaction Prediction in Chemistry

2025· article· en· W4413948581 sur OpenAlexaff
Jian Zhang, Yuming Gu, Qiantu Tao, Linke He, Daojing Li, Yijian Zhang, Yijie Gao, Jiawei Chen, Ziyang Wu, Qingqing Jia, Lifeng Zheng, Shihao Yuan, Yuchuan Chen, Yilin Liu, Zhaopeng Gu, Cheng Zhang, Guoao Li, Tianyu Zhang, Yang Zhou, Yuang Liu, Tianyue Zhang, Zekun Li, Xiaoshi Su, Hongyu Qian, Xuehan Li, Boyuan Zhang, Xu Liu, Yan Zhu, Qiang Zhu, Qian Liu, Shuang Chen, Ziyi Yu, Guixiang Zeng, Yong Liang, Yi Wang, Weigao Xu, Jianyi Wang, Manyi Yang, Yang Gao, Shuhua Li, Yinghuan Shi, Xin Chen, Hao Dong, Wei Li, Jing Ma, Guoqiang Wang

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensMinistry of Education and Child Care
Organismes subventionnairesNational Science and Technology Major ProjectChinese Academy of SciencesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésProperty (philosophy)Domain (mathematical analysis)ChemistryComputer scienceMathematicsPhilosophyEpistemology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Large language models (LLMs) have achieved breakthroughs in natural language processing, yet their use in chemistry is limited by insufficient domain knowledge, high computational demands, and poor scalability. To overcome these challenges, we developed LightChem, a lightweight model that integrates retrieval-augmented generation (RAG) and tool-calling capabilities, providing a platform driven by chemical knowledge and theoretical calculations. LightChem adopts a three-layer architecture, data aggregation, intelligent retrieval, and specialized tool integration, supported by the self-developed RAPTOR system for real-time literature updates. The platform incorporates a suite of computational modules, including automated molecular property prediction (e.g., PoLogP), retrosynthetic planning via ReSynZ, and scalable quantum chemistry packages such as CIM and GEBF, enabling high-accuracy simulations of complex systems. Case studies demonstrate successful predictions of lipophilicity, excitation/emission spectra, and synthetic pathways for drug-like molecules, while large-scale calculations reproduce binding energies in zeolite clusters and excitation energies in GFP chromophores with accuracy comparable to experimental values. Beyond core computations, LightChem features a user-friendly web interface that connects sophisticated algorithms with practical laboratory workflows. It provides modules for reagent management, synthesis assessment, safety evaluation, and experimental design, thereby lowering the barrier for non-specialists and supporting systematic research in photosensitive and functional molecules. Applications to gold nanoclusters and zeolites further highlight the platform’s potential in photocatalysis and optical materials, while also revealing current limitations in predicting HOMO–LUMO gaps and optical properties of complex aggregates. LightChem demonstrates good performance in molecular property prediction, retrosynthetic planning, and large-scale quantum simulations, making it a versatile assistant for chemical research, bridging knowledge-driven reasoning with first-principles accuracy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0040,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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