Genome resequencing and genome‐wide polymorphisms in Chinese population of <i>Phyllotreta striolata</i> (Coleoptera, Chrysomelidae)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The striped flea beetle, Phyllotreta striolata, is a globally notorious pest of cruciferous vegetables. In this study, we sequenced the genome of a Chinese population of P. striolata and aligned it with the reference genome from a Canadian population. Through Illumina sequencing and reference‐based genome polishing, we obtained a high‐quality genome of 131.31 Mb with an N50 size of 8.68 Mb. Genome comparison revealed that the Chinese and Canadian populations of P. striolata presented 175 and 122 population‐specific genes, respectively. Through a genome‐wide screening, six genes were identified as potential RNA interference targets influencing the development or survival of P. striolata. Additionally, we identified 1.16 million high‐confidence variants in the Chinese P. striolata population, including 0.69 million single‐nucleotide polymorphisms and 0.43 million insertions/deletions. Variant effect analysis and functional annotation revealed 7571 variants with high‐impact effects, and the related genes were involved in various basic biological processes in P. striolata. Overall, our findings provide valuable resources for advancing genomic research on P. striolata as well as for those pursuing targeted biopesticides for effective control strategies.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».