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Enregistrement W4413955063 · doi:10.1096/fj.202501859r

The Pathophysiological Functions of Heparanases: From Evolution, Structural and Tissue‐Specific Perspectives

2025· review· en· W4413955063 sur OpenAlexafffund
Elham Vahdatahar, Clément Daviaud, Rachel Havret, Claire Debarnot, Laure Favot, Jean‐François Jégou, Ingrid Fruitier‐Arnaudin, Antoine Dufour, Romain R. Vivès, Franck Morel, Yves Bourne, Kévin Baranger

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2025
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensAlberta Bone and Joint Health Institute
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversité de PoitiersFrench Infrastructure for Integrated Structural BiologyLa Rochelle UniversitéCampus FranceConseil Régional AquitaineLigue Contre le CancerAgence Nationale de la RechercheCentre National de la Recherche ScientifiqueAix-Marseille Université
Mots-clésHeparanaseComputational biologyBiologyPathophysiologyBioinformaticsMedicineHeparan sulfateBiochemistryCellPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heparanase 1 (HPSE1) is a unique endoglycosidase responsible for the enzymatic cleavage of heparan sulfate, thereby playing important functions in cancer processes. In contrast, the structurally related Heparanase 2 (HPSE2) lacks catalytic activity and appears to counteract HPSE1 activities. However, contradictory observations in various pathologies highlight the need for a better understanding of the respective contributions of both heparanases. In this review, we provide a comprehensive resource about the biology of HPSE1 and HPSE2 based on findings from different mouse models, with an emphasis on immune cells and their involvement in skin pathophysiology. In addition, we explore the evolutionary relationships between the two heparanases and describe the structure-function of HPSE2 using the advanced protein-prediction tool AlphaFold 3 (AF3). These approaches unveil new insights for deciphering the functional molecular determinants that distinguish HPSE1 from HPSE2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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