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Enregistrement W4413964957 · doi:10.1101/2025.09.01.672585

Biological landscape of acute illness in children in sub-Saharan Africa and South Asia

2025· preprint· en· W4413964957 sur OpenAlexaff
Evans Mudibo, Charles Sande, Moses M. Ngari, Benjamin H. Jenkins, Benson Singa, Christina Lancioni, Abdoulaye Hama Diallo, Emmie Mbale, Ezekiel Mupere, Roseline Maïmouna Bamouni, Andrew J. Prendergast, Christine J. McGrath, Albert Koulman, Robert Bandsma, Kirkby D. Tickell, Judd L. Walson, James A. Berkley, Gerard Bryan Gonzales, James M. Njunge

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBioinformatics and Genomic Networks
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesWageningen University and ResearchWellcome TrustDepartment for International DevelopmentNational Institute for Health and Care ResearchBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésGeographySouth asiaMedicineEthnologyHistory

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY Childhood illnesses including pneumonia, diarrhoea and malaria are leading causes of hospitalisation and mortality in resource-limited settings. However, we lack understanding of whether systemic responses to such diverse clinical syndromes are shared or specific, how they are impacted by malnutrition and how they differ from well children. We performed multi-omic profiling of plasma proteins, and serum metabolites and lipids in acutely ill hospitalised and well children in sub-Saharan Africa and South Asia. Using network-based clustering and mixed-effects modelling, we identified common and syndrome-specific omics responses to acute illness. We found that malnutrition often modifies host responses to disease. Although the internal structure of individual omics modules was largely preserved between ill and well children, the interactions between these preserved modules were markedly reorganised during acute illness. Compared to well children, biological systems in hospitalised children were more interconnected, exhibiting denser cross-omics interactions. These findings reveal widespread multisystem mobilisation during paediatric acute illness, offer deeper mechanistic insights and highlight candidate pathways for therapeutic intervention in high-burden settings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,030

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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