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Enregistrement W4413968392 · doi:10.1101/2025.08.29.25333303

Li-Fraumeni Syndrome-Associated p53 Variants Disrupt Kidney and Urinary Tract Development

2025· preprint· en· W4413968392 sur OpenAlexaff
Adrian Romero, Alejandra Davilavaladez, Alexandria T.M. Blackburn, Amisheila Kinua, Yogesh Srivastava, D. Gareth Evans, Elizabeth Bancroft, Rosalind A. Eeles, Mark E. Corkins, Rachel K. Miller

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensInstitute of Cancer Research
Organismes subventionnairesUniversity of SouthamptonNational Institute for Health and Care ResearchRoyal Marsden NHS Foundation TrustUniversity Hospital Southampton NHS Foundation TrustPeter MacCallum Cancer CentreUniversity of HullCentral Manchester University Hospitals NHS Foundation Trust
Mots-clésUrinary systemKidneyLi–Fraumeni syndromeCancer researchMedicineKidney cancerBiologyGeneticsMutationInternal medicineCancerGeneGermline mutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Li-Fraumeni Syndrome (LFS) is a rare autosomal dominant disorder that increases the risk of various types of cancer. It is primarily caused by inherited mutations in the TP53 gene. While the tumor suppressor function of p53 is well established, its role in embryonic development, particularly in the formation of the kidney and urinary tract, remains poorly understood. Moreover, its contribution to human congenital anomalies has not been clearly defined. Here, we report that pathogenic TP53 variants can lead to congenital anomalies of the kidney and urinary tract (CAKUT), as well as genital defects (GD), in individuals with LFS. Among 28 unrelated TP53 mutation carriers, 28% (8/28) exhibited CAKUT and/or GD, with a higher frequency observed in individuals carrying structurally disruptive or dominant-negative mutations. We focused on two clinically observed variants: R242W, which destabilizes protein structure, and R282W, a dominant-negative hotspot mutation. AlphaFold modeling showed that both variants cluster within the DNA-binding domain and are predicted to disrupt tetramer formation. In Xenopus laevis, tp53 is expressed in developing nephric structures, consistent with findings from mouse models of nephrogenesis. Expression of either mutant TP53 mRNA in Xenopus embryos disrupted kidney morphogenesis in vivo , supporting a developmental loss-of-function effect. These findings indicate that pathogenic TP53 variants contribute to renal and urogenital defects in LFS. They reveal a previously unrecognized developmental role for p53 and expand the phenotypic spectrum associated with this cancer predisposition syndrome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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