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Enregistrement W4413969725 · doi:10.1016/j.ceca.2025.103069

Regulation of K+-dependent Na+/Ca2+-exchanger subtype 4, NCKX4, by palmitoylation

2025· article· en· W4413969725 sur OpenAlexafffund
By Maryam Al-Khannaq, Jonathan Lytton

Notice bibliographique

RevueCell Calcium · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePlatelet Disorders and Treatments
Établissements canadiensLibin Cardiovascular Institute of Alberta
Organismes subventionnairesLibin Cardiovascular Institute, University of CalgaryNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Alberta
Mots-clésBusiness

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

• NCKX4 is palmitoylated on Cys118 and Cys425. • Palmitoylated NCKX4 has a subcellular distribution similar to total NCKX4 protein. • The level of NCKX4 palmitoylation can change more than two-fold within 6 h. • Altering the level of NCKX4 palmitoylation influences its subcellular distribution. • Altering palmitoylation has no effect on cellular NCKX4-mediated Ca2+ transport. Mammalian K + -dependent Na + /Ca 2+ exchangers (NCKX), encoded by the SLC24 gene family, are crucial for maintaining Ca 2+ homeostasis. NCKX4, widely expressed in the brain and sensory neurons, plays a key role in neuronal satiety and enamel formation. Despite its importance, the regulatory mechanisms of NCKX4 remain largely unexplored. This study investigates how palmitoylation, a post-translational modification affecting membrane proteins, regulates NCKX4 and influences its cellular localization and function. Using Acyl-RAC and palmitate-based click-chemistry, we found that approximately 14% of NCKX4 is palmitoylated at steady-state in both endogenous and transfected systems. The level of this modification is highly dynamic, being regulated by inhibitors of palmitoylation (2-bromopalmitate) and depalmitoylation (palmostatin B), resulting in greater than a two-fold decrease or increase, respectively. Site-directed mutagenesis of six cysteine residues revealed two key sites (Cys118 and Cys425) critical for NCKX4 palmitoylation. The subcellular distribution of palmitoylated NCKX4 was examined via proximity ligation and click-chemistry. NCKX4 was found across multiple membrane compartments, with a higher fraction localizing to the plasma membrane when palmitoylation was inhibited by 2-bromopalmitate. However, a Ca 2+ imaging assay in HEK293T cells showed no significant change in aggregate cellular NCKX4-mediated Ca 2+ transport upon modulation of palmitoylation status. These data suggest palmitoylation promotes internalization of the NCKX4 protein while also activating it, counter-acting effects that result in unchanged NCKX4-mediated cellular Ca 2+ transport activity. In summary, NCKX4 is subject to dynamic palmitoylation, which influences both distribution across cellular compartments and intrinsic Ca 2+ transport activity. These findings contribute to our understanding of the regulation and functional roles of NCKX4 in cellular physiology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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