Demixing of four simultaneously co-expressed phase-separating proteins in the endoplasmic reticulum lumen
Notice bibliographique
Résumé
Intracellular protein crystallization represents an intriguing form of biomolecular assembly. While the list of intracellularly crystallizing proteins is growing and their physiological roles are being elucidated, the underlying requirements and processes for intracellular crystallogenesis remain largely unknown. To reveal cellular capacity and morphological plasticity to accommodate protein crystals and crystal-like inclusion bodies, this study examines how simultaneously co-expressed phase-separating proteins influence each other's behavior in the endoplasmic reticulum (ER) lumen. To this end, four cargoes were selected based on their ability to produce distinctive inclusion body types and morphologies irrespective of originating species, function, or sequence homology. The co-expressed model proteins independently phase-separated into distinctive inclusions and coexisted in the ER without losing their signature morphologic characteristics. The continued growth of intra-ER protein crystals and droplets suggested that co-expressed cargo proteins were continuously synthesized and folded in the ER, thereby fueling the growth of the corresponding inclusion bodies. Thus, even in the crowded ER environment, each of the four overexpressed cargo proteins can find their mates through self-association and assemble into four unique structures in the ER. This study demonstrates that cells can accommodate up to four distinct types of mesoscale inclusion bodies in the ER lumen simultaneously, and the respective phase-separation events proceed without interfering with each other and without morphological mixing.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».