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Enregistrement W4413973019 · doi:10.1126/sciadv.adw7764

Bordetellae colonization oligosaccharide (b-Cool), a glycan crucial for nasal colonization

2025· article· en· W4413973019 sur OpenAlexaff
Yang Su, Maiya Callender, Dylan Woolsey, Colleen Sedney, M Vu, Jillian Masters, Amanda D. Caulfield, Kalyan K. Dewan, Emily Gaskill, A. Aldrin Joshua, Christopher M. Evans, John Glushka, Evgeny Vinogradov, Andrew Preston, Thomas M. Krunkosky, Maor Bar‐Peled, Eric T. Harvill

Notice bibliographique

RevueScience Advances · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBacterial Infections and Vaccines
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésColonizationBordetella bronchisepticaMucinMicrobiologyBiologyBordetellaBordetella pertussisBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Respiratory tract infections pose considerable global health challenges. Upper airway colonization is pivotal to these infections, including those caused by Bordetella species. We identified an oligosaccharide, bordetellae colonization oligosaccharide (b-Cool), crucial for early nasal colonization of Bordetella bronchiseptica . We characterized the structure of b-Cool by LC-MS and NMR and found that it is prevalent across a diverse range of bordetellae, including Bordetella pertussis , which causes whooping cough in humans. A B. bronchiseptica mutant lacking b-Cool (Δ b-Cool ) showed significantly delayed and decreased colonization in mouse nasopharynx and nasal epithelia, resulting in decreased transmission. The colonization defect of Δ b-Cool was rescued in mucin deficient mice, suggesting that b-Cool may facilitate colonization in the presence of airway mucins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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