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Enregistrement W4413980852 · doi:10.1073/pnas.2504185122

A thermodynamic perspective on mammalian neural crest ingression

2025· article· en· W4413980852 sur OpenAlexafffund
Clarissa C. Pasiliao, Evan Thomas, Theodora Yung, Min Zhu, Hirotaka Tao, Yu Sun, Sidhartha Goyal, Sevan Hopyan

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada First Research Excellence Fund
Mots-clésIngressionNeural crestProcess (computing)Cell biologyCellBiologyBiological systemComputer scienceGastrulationEmbryoEmbryogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ingression of neural crest cells from an ectodermal to a mesodermal layer is regulated by instructive, directional cues and potentially stochastic, biophysical parameters such as differential cell adhesion and tension heterogeneity. However, a cohesive framework in which to consider how various influences contribute to ingression remains elusive. Here, we observe the cell behaviors of the murine neural crest in three dimensions over time and apply a free energy framework to more wholly understand why cells ingress. Guided by work on granular matter that provides a path by which to define the roles of stochastic mechanisms in nonequilibrium systems, we measured and manipulated biophysical parameters in vivo. The data suggest that an energy barrier to cell ingression is overcome by a combination of relatively favorable cell adhesion energies, high cell shape fluctuations, and entropic cell packing configurations. Under those conditions, cell ingression may proceed spontaneously. Recognized biophysical cues likely tilt these parameters to make the process more robust. The results imply that dissipative mechanisms which transiently disorder tissue may underlie some morphogenetic events. Variations of a thermodynamic framework can potentially be applied to integrate various inputs that drive morphogenesis in different contexts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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