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Enregistrement W4413986962 · doi:10.1128/jvi.00435-25

An RGD motif on SARS-CoV-2 Spike induces TGF-β signaling and downregulates interferon

2025· article· en· W4413986962 sur OpenAlexaff
Nicholas P. Gracie, Anupriya Aggarwal, Rachel Luo, Sobia Idrees, Caroline L. Ashley, Sibel Alca, Timothy Ison, Megan Steain, Karishma Patel, Rezwan Siddiquee, Jason K. K. Low, Joel P. Mackay, Christopher E. Denes, G. Gregory Neely, Alen Faiz, Stuart Turville, Timothy P. Newsome

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyRGD motifIntegrinSignal transductionCoronavirusCell biologyActivator (genetics)ReceptorMolecular biologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)GeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) spike (S) protein mediates canonical cell entry via ACE2 and has also been implicated as an activator of a diverse range of signaling pathways. Here, we present evidence that the RGD (Arg-Gly-Asp) motif within the receptor-binding domain (RBD) of the S1 fragment of the S protein induces TGF-β cytokine expression. RGD peptides are well characterized as ligands for a subset of integrin complexes primarily containing α5 and αV subunits. In this study, we investigate the molecular basis of TGF-β pathway activation by S protein, delivered to cells as recombinant protein, in pseudotyped virus or in virally infected cells. Activation of TGF-β signaling by the S protein requires ACE2 and leads to SMAD3-dependent expression of the pro-fibrotic marker PAI-1. Utilizing pseudotyped viruses, expression of the S protein with a mutated RGD motif abolished TGF-β signaling, as did the RGD antagonist ATN-161, implicating integrin complexes in mediating this response. We show that the S protein RGD motif suppresses IFN-β expression via TGF-β, leading to a disruption in cellular antiviral defenses, consistent with TGF-β's role in immunosuppression. These findings further support the multifunctionality of S protein and provide mechanistic insights into its activity as a virulence factor during infection. IMPORTANCE: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) presents an ongoing public health challenge as a cause of acute illness and post-acute sequelae of COVID-19 (PASC, or long COVID). Our study identifies the RGD integrin-binding motif in the spike (S) protein as central to the cellular response to SARS-CoV-2, leading to the expression of the pleiotropic cytokine TGF-β and disabling of antiviral immunity. This work further supports the S protein-to-integrin complex signaling axis as a potential therapeutic target. The RGD motif might also be a valid target for treating PASC given the increasing body of evidence implicating the presence of persistent S protein in the etiology of this disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,382
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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