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Enregistrement W4413988607 · doi:10.1021/acssensors.5c01213

Enabling Fluorescence Lifetime Imaging Multiplexing Using UnaG through Its Modification with Canonical and Noncanonical Amino Acids

2025· article· en· W4413988607 sur OpenAlexaff
Valentina V. Terekhova, Daria V. Bodunova, Egor S. Gorokhov, Georgy V. Tsoraev, Svetlana V. Sidorenko, Ruslan Vasilev, С. А. Левицкий, Piotr Kamenski, A. V. Loktyushkin, Sergey I. Kovalchuk, Е. П. Лукашев, Yulia A. Bogdanova, Alexey M. Bogdanov, Tatiana I. Mulashkina, Maria G. Khrenova, Daniil A. Gvozdev, Boris P. Yakimov, Evgeny A. Shirshin, Thomas Friedrich, Nediljko Budiša, А. В. Степанов, Nikolai N. Sluchanko, Михаил С. Баранов, Eugene G. Maksimov, М. П. Кирпичников

Notice bibliographique

RevueACS Sensors · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Fluorescence Microscopy Techniques
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesRussian Science Foundation
Mots-clésMultiplexingFluorescenceChemistryNon canonicalAmino acidSurface modificationCombinatorial chemistryComputer scienceNanotechnologyMaterials scienceComputational biologyBiochemistryCell biologyPhysicsBiologyPhysical chemistryTelecommunicationsOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fluorogen-activating proteins are powerful molecular tools for microscopy, including functional imaging. These proteins serve as an alternative to GFP-like proteins, as they do not require oxygen for chromophore maturation. However, the restricted selectivity of proteins to chromophores, combined with the limited number of spectral channels of conventional fluorescent microscopes, hinders the development of multicolor synthetic dyes. Additionally, the poor cell and tissue permeability of synthetic chromophores further limits their utility. In this work, we address these challenges by combining time-resolved methods with the rational design of the UnaG protein, which utilizes bilirubin as a natural chromophore. To turn UnaG into a palette of probes for fluorescence lifetime imaging microscopy (FLIM), we solved two practical problems: first, we determined the limits of bilirubin lifetime variations in response to changes in the protein structure and, second, we determined what minimal structural changes can be reliably distinguished by lifetime analysis in cellula . Combining classical point mutagenesis and the translational introduction of noncanonical amino acids, we generated UnaG with fluorescence lifetimes ranging from hundreds of picoseconds to nanoseconds. We explored the potential for further modification of the UnaG protein matrix to optimize spectral and temporal characteristics of bilirubin fluorescence and its quantitative detection through time-resolved approaches.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,905

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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