Network pharmacology prediction and experimental validation to explore the potential mechanism of Danggui Shaoyao San against Acute Kidney Injury
Notice bibliographique
Résumé
ETHNOPHARMACOLOGICAL RELEVANCE: Acute kidney injury (AKI) is a growing worldwide health concern. Danggui Shaoyao San (DGSYS) was an frequently-used representative prescription to "promote blood and water and harmonize the body" in traditional Chinese medicine, and its underlying mechanism against AKI remains to be elucidated. AIM OF THE STUDY: To investigate the protective effect and potential molecular mechanism of DGSYS in alleviating AKI by network pharmacology and experiment validation. MATERIALS AND METHODS: DGSYS was analyzed and separated by UHPLC. Network pharmacology, molecular docking and molecular dynamics simulation were used to screen the active ingredient-target pathway of DGSYS for AKI treatment. Meanwhile, the predictions were experimentally validated both in vivo and in vitro. RESULTS: 30 bioactive compounds and 821 non-repetitive targets were screened for DGSYS, and 292 potential DGSYS-AKI intersection targets were identified. According to the protein-protein interaction results and GO and KEGG analyses, we found that apoptosis mediated by SRC pathway exerted a vital role in DGSYS against AKI. In vivo experiments indicated that DGSYS mitigated I/R-induced kidney injury by suppressing SRC signaling pathway. Molecular docking and molecular dynamics simulation revealed that paeoniflorin (PF) have good binding affinity to SRC. Subsequently, in vitro experiments suggested that PF was the key bioactive compound against AKI from DGSYS by inhibiting SRC/ERK1/2 signaling pathway. CONCLUSION: We exhibited the promising anti-AKI mechanism of DGSYS, and our findings also opened up an avenue for future basic experimental validation, indicating a novel research direction.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».