Structural Elements of Dwarf Open Reading Frame Required for Activation of the Sarco-Endoplasmic Reticulum Calcium Pump
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The sarco-endoplasmic reticulum calcium pump (SERCA) is a P-type ATPase that plays a critical role in intracellular calcium signaling. SERCA maintains the calcium gradient between the cytosol and the sarco-endoplasmic reticulum, which is essential for a variety of physiological events including the muscle contraction-relaxation cycle. In cardiac muscle, SERCA is regulated by transmembrane peptides phospholamban (PLN) and dwarf open reading frame (DWORF). These peptides encode the opposing functions of SERCA inhibition by PLN and SERCA activation by DWORF, though the underlying mechanisms remain unclear. Herein, we investigated structural elements of DWORF expected to play a role in SERCA activation. We first measured SERCA activity in the absence and presence of DWORF variants targeting Leu12 and Pro15. These residues were selected based on sequence alignment with PLN. Leu12 and Pro15 of DWORF align with the essential residues Leu31 and Asn34 of PLN, which are required for SERCA inhibition. We found that both residues are required for SERCA activation by DWORF and that substitution of Pro15 (to Ala, Asn, or Leu) resulted in potent inhibition of SERCA. We next investigated the roles of Gly21, Ile23, and Gly25 in SERCA activation and DWORF oligomerization. These residues are part of a common helix interaction motif, GxxxG (Gly21-Trp-Ile-Val-Gly25) found in DWORF, which is unique among the regulins. The data suggest that the GxxxG motif does not play a role in DWORF oligomerization. Instead, this motif appears to interact with SERCA and provides a smooth interface that promotes activation and avoids inhibitory interactions with SERCA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».