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Enregistrement W4414035667 · doi:10.1085/jgp.202413636

NALCN/Cch1 channelosome subunits originated in early eukaryotes

2025· article· en· W4414035667 sur OpenAlexafffund
Adriano Senatore, Tatiana D. Mayorova, Luis Alfonso Yáñez-Guerra, Wassim Elkhatib, Brian Bejoy, Philippe Lory, Arnaud Monteil

Notice bibliographique

RevueThe Journal of General Physiology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMarine Sponges and Natural Products
Établissements canadiensCanadian Celiac AssociationCanada Research ChairsUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Toronto MississaugaUniversity of TorontoAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésBiologyProtein subunitPhylogenetic treeEvolutionary biologyContext (archaeology)GeneticsPhylogeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The sodium leak channel NALCN, a key regulator of neuronal excitability, associates with three ancillary subunits that are critical for its function: a subunit called FAM155, which interacts with the extracellular regions of the channel, and two cytoplasmic subunits called UNC79 and UNC80. Interestingly, NALCN and FAM155 have orthologous phylogenetic relationships with the fungal calcium channel Cch1 and its subunit Mid1; however, UNC79 and UNC80 have not been reported outside of animals. In this study, we leveraged expanded gene sequence data available for eukaryotes to reexamine the evolutionary origins of NALCN and Cch1 channel subunits. Our analysis corroborates the direct phylogenetic relationship between NALCN and Cch1 and identifies a larger clade of related channels in additional eukaryotic taxa. We also identify homologues of FAM155/Mid1 in Cryptista algae and UNC79 and UNC80 homologues in numerous non-metazoan eukaryotes, including basidiomycete and mucoromycete fungi and the microbial eukaryotic taxa Apusomonadida, Malawimonadida, and Discoba. Furthermore, we find that most major animal lineages, except ctenophores, possess a full complement of NALCN subunits. Comparing structural predictions with the solved structure of the human NALCN complex supports orthologous relationships between metazoan and non-metazoan FAM155/Mid1, UNC79, and UNC80 homologues. Together, our analyses reveal unexpected diversity and ancient eukaryotic origins of NALCN/Cch1 channelosome subunits and raise interesting questions about the functional nature of this channel complex within a broad, eukaryotic context.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,393
Score d'incertitude au seuil0,321

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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