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Enregistrement W4414042620 · doi:10.1101/2025.09.03.673792

Disrupted Lipid Homeostasis as a Pathogenic Mechanism in <i>ABCA7</i> -Associated Alzheimer’s Disease Risk

2025· preprint· en· W4414042620 sur OpenAlexaff
Younji Nam, Brooke A. DeRosa, Aura M. Ramírez, Biniyam A. Ayele, Larry D. Adams, C. Golightly, Takiyah D. Starks, Holly N. Cukier, Rufus Akinyemi, Fred Stephen Sarfo, Albert Akpalu, Michael L. Cuccaro, Scott M. Williams, Allison Caban‐Holt, Christiane Reitz, Jonathan L. Haines, Farid Rajabli, Derek M. Dykxhoorn, Juan I. Young, Jeffery M. Vance, Margaret A. Pericak‐Vance

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholesterol and Lipid Metabolism
Établissements canadiensColumbia College
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHomeostasisLipid metabolismMechanism (biology)DiseaseLipid signalingLipid accumulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract INTRODUCTION ABCA7 ( ATP-binding cassette sub-family A member 7 ) encodes a lipid transporter linked to Alzheimer’s disease (AD). While common variants confer modest risk in Europeans, a 44-base pair deletion (rs142076058; p.Arg578Alafs) is a strong risk factor in African Americans (AA). Despite this, the biological consequences of this ancestry-specific variant are not well understood. METHODS We expressed the truncated ABCA7 protein in HEK and HepG2 cells to assess localization and lipid metabolism. Additionally, induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived neurons carrying the deletion were compared with isogenic controls. RESULTS The truncated ABCA7 localized to the plasma membrane similarly to wild type but induced significant lipid droplet accumulation in HepG2 cells and iPSC-derived neurons. DISCUSSION These findings show that the AA-specific ABCA7 deletion disrupts lipid regulation despite normal localization, suggesting a mechanistic link between impaired lipid homeostasis and increased AD risk. This work underscores the importance of ancestry-specific studies in AD research. Highlights Truncated ABCA7 protein remains stable and correctly localizes to the plasma membrane in HEK293T cells. Truncated ABCA7 disrupts lipid droplet regulation in HepG2 cells. ABCA7 shows the highest expression in neurons among brain cell types. ABCA7 truncation impairs lipid metabolism in neurons.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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