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Enregistrement W4414044484 · doi:10.1101/2025.09.02.673726

Surface proteomics reveals arginine metabolism as a vulnerability in high grade serous ovarian cancer

2025· preprint· en· W4414044484 sur OpenAlexafffund
Meinusha Govindarajan, Matthew Waas, Brian Lin, Tianyi Ling, Ximing Li, Vladimir Ignatchenko, Anastasia N. Tikhonova, Courtney L. Jones, Laurie Ailles, Thomas Kislinger

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Research and Treatments
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCommon FundNational Human Genome Research InstituteNational Institute on Drug AbuseNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute of Mental HealthNIH Office of the DirectorMcGill UniversityNational Cancer InstituteTerry Fox FoundationNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésOvarian cancerProteomicsArginineProteomeCellSerous ovarian cancerSerous fluidStromal cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Background The significant lethality of high-grade serous ovarian cancer (HGSC) is driven by the lack of long-term efficacy of current treatments, underscoring the need for developing additional therapeutics. Cell surface proteins represent attractive therapeutic targets yet remain underexplored in high-grade serous ovarian cancer. Here, we employed cell surface N -glycoproteomics to elucidate the cell surface proteomes of HGSC cells alongside normal epithelial and cancer-associated stromal cells, uncovering new opportunities for therapeutic intervention. Results Integration of cell surface N -glycoproteomics and functional screening revealed multiple minimally characterized, HGSC-enriched surface proteins that are critical for HGSC proliferation – most notably, SLC7A1. Multi-omic and functional characterization indicated that SLC7A1 is necessary for HGSC migration, protein synthesis and mitochondrial functions likely linked to its role as an arginine transporter. Finally, we demonstrate that elevated surface expression of SLC7A1 in HGSC reflects dysregulated arginine metabolism, pointing to a putative therapeutic vulnerability. Conclusions Our work identifies SLC7A1 and arginine metabolism as a previously unrecognized molecular vulnerability in HGSC and provides a framework to guide future therapeutic development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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