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Enregistrement W4414062902 · doi:10.3390/mps8050104

A Safe and Accessible Cell-Based Spike–ACE2 Binding Assay for Evaluating SARS-CoV-2 Neutralization Activity in Biological Samples Using Flow Cytometry

2025· article· en· W4414062902 sur OpenAlexafffund
Martín A. Rossotti, Shannon Ryan, Greg Hussack, Jamshid Tanha, Bassel Akache, Tyler M. Renner

Notice bibliographique

RevueMethods and Protocols · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensInstitute of Infection and ImmunityUniversity of OttawaNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesNational Research Council Canada
Mots-clésNeutralizationMononegaviralesFlow cytometryVirusVirus inactivationRecombinant DNANeutralizing antibodyBioassayEbola virus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SARS-CoV-2, the agent responsible for coronavirus disease in 2019 (COVID-19), has caused extensive global health and socioeconomic impact due to its transmissibility and pathology. As a result, it was classified as a Risk Group 3 human pathogen, and handling samples containing live virus requires enhanced biological containment facilities (i.e., CL3) to reduce the potential of laboratory infection to personnel and the spread of the virus into the community. While the use of an authentic live virus remains the gold standard for biological assays, alternative methods have been developed to effectively evaluate neutralization activity in the absence of a replicating viral agent. Here, we describe a cell-based spike-ACE2 binding assay as a surrogate for neutralization of SARS-CoV-2 spike to identify potential neutralizing antibodies. A main advantage of this approach is the exclusion of infectious viral particles, increasing biosafety for laboratory personnel. The interaction of recombinant SARS-CoV-2 trimeric spike protein with ACE2 is monitored and quantified by flow cytometry. Notably, our previous studies have demonstrated the utility of this assay for other viruses, beyond SARS-CoV-2. The methodology presented here has exhibited a strong correlation to other widely accepted methods, such as pseudotyped lentiviral and live virus neutralization assays, in identifying neutralizing antibodies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,404
Score d'incertitude au seuil0,674

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,366
Tête enseignante GPT0,586
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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