<scp>SCL15</scp> Regulates the Release of Seed Dormancy in <scp> <i>Arabidopsis thaliana</i> </scp> by Integrating the Circadian Clock, Hormonal Signals and Cell Wall Remodelling
Notice bibliographique
Résumé
Dormancy release and germination of the seed are two separate, but continuous phases controlled by both external (e.g., light and temperature) and internal (e.g., circadian clock and hormones) cues. In eudicot seeds, the endosperm tissues play a key role in dormancy release and germination through dynamic modulation of wall components and biomechanics. However, the mode of action by which the circadian oscillator influences dormancy release by modulation of endosperm wall biomechanics remains elusive. SCARECROW-LIKE15 (SCL15) represses embryonic gene expression in seedlings through interaction with HISTONE DEACETYLASE19 (HDA19) in Arabidopsis thaliana. Here, we report that SCL15 plays a positive role in primary dormancy release, which is associated with gene expression changes in circadian, abscisic acid, auxin and cell wall (CW) remodelling pathways, based on studies using SCL15 mutant and Napin promoter-driven SCL15 expression lines. SCL15 was found to affect the expression of genes whose products modify endosperm wall biomechanical features, possibly through regulation of local auxin accumulation and evening-phased clock components. RNA-seq analysis supported the notion that dormancy release is associated with changes in the expression of genes associated with circadian and hormone-mediated pathways, which in turn affect CW structure.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».