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Enregistrement W4414069179 · doi:10.1111/ppl.70467

<scp>SCL15</scp> Regulates the Release of Seed Dormancy in <scp> <i>Arabidopsis thaliana</i> </scp> by Integrating the Circadian Clock, Hormonal Signals and Cell Wall Remodelling

2025· article· en· W4414069179 sur OpenAlexafffund
Mingjun Gao, Qi Chen, Cathy Coutu, Fuyou Fu, Bianyun Yu, Xiang Li, Z. Jeffrey Chen, Dwayne D. Hegedus

Notice bibliographique

RevuePhysiologia Plantarum · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesArizona Biomedical Research CommissionAgriculture and Agri-Food CanadaGovernment of Canada
Mots-clésEndospermDormancyAuxinCircadian clockArabidopsisCircadian rhythmAbscisic acidSeed dormancy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dormancy release and germination of the seed are two separate, but continuous phases controlled by both external (e.g., light and temperature) and internal (e.g., circadian clock and hormones) cues. In eudicot seeds, the endosperm tissues play a key role in dormancy release and germination through dynamic modulation of wall components and biomechanics. However, the mode of action by which the circadian oscillator influences dormancy release by modulation of endosperm wall biomechanics remains elusive. SCARECROW-LIKE15 (SCL15) represses embryonic gene expression in seedlings through interaction with HISTONE DEACETYLASE19 (HDA19) in Arabidopsis thaliana. Here, we report that SCL15 plays a positive role in primary dormancy release, which is associated with gene expression changes in circadian, abscisic acid, auxin and cell wall (CW) remodelling pathways, based on studies using SCL15 mutant and Napin promoter-driven SCL15 expression lines. SCL15 was found to affect the expression of genes whose products modify endosperm wall biomechanical features, possibly through regulation of local auxin accumulation and evening-phased clock components. RNA-seq analysis supported the notion that dormancy release is associated with changes in the expression of genes associated with circadian and hormone-mediated pathways, which in turn affect CW structure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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