A Critical Review of Bovine Viral Diarrhea Virus: Spotlights on Host Plasticity and Potential Spillover Events
Notice bibliographique
Résumé
The bovine viral diarrhea virus (BVDV) infects a wide range of domestic and wild mammals. This review hypothesized that there might be cross-species transmission of BVDV. Therefore, the aim was to explore the BVDV-5' UTR and N-pro sequence-based evidence to understand host plasticity among different animals. A total of 146 unique BVDV sequences retrieved from GenBank, originating from 12 distinct mammalian species that are submitted from 55 countries, were analyzed. The phylogenetic analysis revealed that all three BVDV species exhibited genetic relatedness infecting diverse animal species. BVDV-1 sequences obtained from cattle, buffalo, and pigs and BVDV-2 and HoBi-like pestivirus sequences from cattle, goats, and sheep showed a genetic resemblance. Surprisingly, cattle and buffalo in China, cattle and yak in Mongolia, cattle and wild boar in Serbia, cattle and deer in Mexico, cattle and alpacas in Canada, goats and pigs in the USA, and sheep and buffalo in Argentina were infected with BVDV-1 within the same county and strongly positioned in the same cluster, indicating potential spillover with host tropism. Moreover, BVDV sequences isolated from various neighboring countries clustered closely, suggesting potential cross-border transmission events. Based on genomic evidence, the BVDV transmission cycle could be depicted, where cattle act as a primary source of infection, while other domestic and wild animals maintain the infection ecology within their habitat due to virus tropism.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».