Variations in carbapenem resistance associated with the VIM-1 metallo-β-lactamase across the <i>Enterobacterales</i>
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT The VIM-1 metallo-β-lactamase enzyme, encoded as a cassette within class 1 integrons, is found in Gram-negative clinical isolates worldwide and has been linked to outbreaks of bacterial pathogens in nosocomial settings. Six vim-1 + clinical isolates, from the genera Escherichia , Klebsiella , and Enterobacter , were obtained from Kingston, Ontario, Canada. Whole genome sequencing revealed that vim-1 was plasmid-borne in all strains and situated as the first gene in In916 or In110 integrons. Analysis of related plasmids suggested that these vim-1 -containing plasmids are globally disseminated and have spread via horizontal gene transfer and autochthonous vertical spread within Ontario. Interestingly, the minimum inhibitory concentrations of ertapenem and meropenem, two clinically relevant carbapenem antibiotics, against these six isolates varied more than tenfold, suggesting the effects of VIM-1 are dependent on the genomic content of the host microbe. To further study the genomic content dependency of VIM-1, we introduced vim-1 into three common Enterobacterales laboratory strains. Although introduction of vim-1 into Escherichia coli DH5α resulted in little resistance to ertapenem or meropenem, multiple rounds of adaptive laboratory evolution allowed us to identify variants with extremely high levels of resistance to both carbapenems. DNA sequencing revealed that the increase in carbapenem resistance was due to a combination of increased vim-1 gene dosage and epistatic interactions with mutations of ompC that likely would have decreased outer membrane permeability to these antibiotics. Together, these results provide additional support for the role of gene epistasis is modulating the antimicrobial resistance phenotypes of acquired resistance genes, as well as previous results suggesting that the presence of a β-lactamase gene is insufficient to confer strong resistance to carbapenems without being paired with reduced outer membrane permeability.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».