Isolation and characterization of potentially ochratoxigenic fungi from Costa Rican coffee ( <i>Coffea arabica</i> L.) beans
Notice bibliographique
Résumé
Coffee plants and beans are prone to fungal contamination that pose health risks to consumers by producing mycotoxins like ochratoxin A (OTA). Thus, the present study aimed to analyze the mycobiota of Costa Rican coffee beans, focusing on potentially ochratoxigenic species and their in vitro susceptibility patterns to antifungal agents. Fungal isolates were obtained from cherry, green, and roasted coffee beans from Costa Rica; they were identified by morphology, MALDI-TOF technology, and sequencing. The isolation frequency (FR) was 33.10% for all the samples analyzed, 49.51% for the cherry fruits, 37.67% for the green coffee beans, and 17.33% for the roasted beans. The cherry beans were mainly contaminated with Geotrichum klebahni (46.34% FR and 90.91% relative density (RD)), while the green and roasted coffee beans were mainly infected with Aspergillus spp. (22.00% FR and 55.23% RD and 13.83% FR and 77.57% RD, respectively). A total of 46.67% of A. westerdijkiae and 20.00% of A. ochraceus produced fluorescence in YES broth related with ochratoxin production. The isolates of the Aspergillus section Circumdati were susceptible to the azole antifungals. Costa Rican coffee beans could be contaminated with mycotoxigenic fungi during storage.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».