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Enregistrement W4414103853 · doi:10.3389/fcimb.2025.1622241

Providing a rest stop during transportation affects the respiratory bacterial microbiota of beef cattle

2025· article· en· W4414103853 sur OpenAlexaff
Muhammed Salah Uddin, Emmanuel W. Bumunang, Matthew Waldner, K. S. Schwartzkopf-Genswein, Daniela M Meléndez, Yan D. Niu, Trevor W. Alexander

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cellular and Infection Microbiology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMicrobial infections and disease research
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of CalgaryUniversity of Lethbridge
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRest (music)Beef cattleIncidence (geometry)Bovine respiratory diseaseRisk factorRespiratory systemMicrobial toxins

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Bovine respiratory disease (BRD) is a significant health concern in beef cattle production, leading to substantial economic losses. In North America, beef cattle are frequently transported over long distances for placement into feedlots. The respiratory microbiota of cattle, including pathogens, can change after feedlot entry. However, there is limited information on how bacteria are impacted when cattle are offloaded for a rest stop during transportation. Results This study investigated the effects of a rest stop during transportation on the nasopharyngeal (NP) microbiota of beef cattle. Two separate trials (N = 80 calves per trial) were conducted with treatment groups assigned to rest stop durations of 12 h (Study 1) and 8 h (Study 2), being compared to control animals without a rest stop. In Study 1, cattle were acclimated to a feedlot prior to transportation while in Study 2, cattle were unacclimated. Following transportation and a rest interval, calves were placed into a feedlot and sampled by NP swab periodically for 28 days. Across treatments and time, the most abundant genera included Mycoplasma, Histophilus, Mannheimia, Pasteurella, Moraxella, and Acinetobacter. In both studies, microbial diversity and structure were not affected by providing a rest stop. However, NP swabs from more sampling time points had elevated levels of the BRD-associated genera Mannheimia, Histophilus, and Mycoplasma when the microbiota of calves provided rest were compared to animals given no rest. Conclusion Based solely on the increased abundance of BRD-associated bacteria, providing a rest stop during transportation may be a risk factor for BRD. However, it was not possible to associate rest stop-induced changes in microbiota with disease outcome due to a low incidence of BRD. Further evaluation using large-scale studies will help define the impact of a rest stop during transportation, on BRD pathogens and incidence in feedlots.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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