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Enregistrement W4414110370 · doi:10.1007/s12374-025-09488-2

ELF18-INDUCED LONG NONCODING RNA 25 positively regulates the pathogen defense-related CYP82C2 expression in Arabidopsis

2025· article· en· W4414110370 sur OpenAlex
Jun Sung Seo, Jimin Lee, Nuri Oh, Soyoung Jang, Youngran Cho, Jin-Ho Kang, Jang‐Kyun Seo, Hye Sun Cho, Moonhyuk Kwon, Choonkyun Jung

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Plant Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensInstitute of Aging
Organismes subventionnairesNational Research Foundation of KoreaRural Development AdministrationSeoul National UniversityNational Research Foundation
Mots-clésGeneLong non-coding RNAGene expressionArabidopsisSubfamilyMutantRegulation of gene expressionMicroarray analysis techniquesRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Long noncoding RNAs (lncRNAs) are emerging as important regulators of gene expression during plant immune responses. In this study, we identified a novel lncRNA, ELF18-INDUCED LONG NONCODING RNA 25 ( ELENA25 ), located in the intergenic region between AT4G31960 and CYTOCHROME P450, family 82, subfamily C, polypeptide 2 ( CYP82C2 ) in Arabidopsis. ELENA25 was initially identified through custom lncRNA microarray data. Here, its full-length sequence (810 bp) was determined using primer walking and confirmed by sequencing. ELENA25 expression was preferentially induced by flg22, a bacterial pathogen-associated molecular pattern (PAMP), in a late-phase and FLS2 receptor-dependent manner. Neighboring genes AT4G31960 and CYP82C2 were also flg22-inducible, with expression abolished in the fls2 mutant background. To assess whether ELENA25 regulates the expression of nearby genes, we generated ELENA25 -overexpressing (OX) and knockout (KO) plants. In ELENA25 OX lines, CYP82C2 expression was significantly upregulated under normal and flg22-treated conditions, while AT4G31960 expression remained unchanged. Conversely, in the elena25 mutants (KO), CYP82C2 expression was significantly reduced, indicating that ELENA25 positively regulates CYP82C2 transcription. Expression levels of other nearby cytochrome P450 genes, including CYP82C3 and CYP82C4 , and other indole glucosinolate-related CYP genes were not affected by ELENA25 expression changes. Collectively, our results demonstrate that ELENA25 is a flg22-inducible lncRNA that specifically enhances CYP82C2 expression in a FLS2-dependent manner. This study provides new insights into the role of lncRNAs in plant innate immunity, highlighting ELENA25 as a positive regulator of defense-related gene expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,699
Score d'incertitude au seuil0,191

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle