ELF18-INDUCED LONG NONCODING RNA 25 positively regulates the pathogen defense-related CYP82C2 expression in Arabidopsis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Long noncoding RNAs (lncRNAs) are emerging as important regulators of gene expression during plant immune responses. In this study, we identified a novel lncRNA, ELF18-INDUCED LONG NONCODING RNA 25 ( ELENA25 ), located in the intergenic region between AT4G31960 and CYTOCHROME P450, family 82, subfamily C, polypeptide 2 ( CYP82C2 ) in Arabidopsis. ELENA25 was initially identified through custom lncRNA microarray data. Here, its full-length sequence (810 bp) was determined using primer walking and confirmed by sequencing. ELENA25 expression was preferentially induced by flg22, a bacterial pathogen-associated molecular pattern (PAMP), in a late-phase and FLS2 receptor-dependent manner. Neighboring genes AT4G31960 and CYP82C2 were also flg22-inducible, with expression abolished in the fls2 mutant background. To assess whether ELENA25 regulates the expression of nearby genes, we generated ELENA25 -overexpressing (OX) and knockout (KO) plants. In ELENA25 OX lines, CYP82C2 expression was significantly upregulated under normal and flg22-treated conditions, while AT4G31960 expression remained unchanged. Conversely, in the elena25 mutants (KO), CYP82C2 expression was significantly reduced, indicating that ELENA25 positively regulates CYP82C2 transcription. Expression levels of other nearby cytochrome P450 genes, including CYP82C3 and CYP82C4 , and other indole glucosinolate-related CYP genes were not affected by ELENA25 expression changes. Collectively, our results demonstrate that ELENA25 is a flg22-inducible lncRNA that specifically enhances CYP82C2 expression in a FLS2-dependent manner. This study provides new insights into the role of lncRNAs in plant innate immunity, highlighting ELENA25 as a positive regulator of defense-related gene expression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».