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Enregistrement W4414129354 · doi:10.1097/qai.0000000000003763

HIV Drug Resistance Among Key Populations in Nigeria: Insights From the 2020 Integrated Biological and Behavioral Surveillance Survey

2025· article· en· W4414129354 sur OpenAlexafffund
Stephanie Melnychuk, Kalada Green, Chukwuebuka Ejeckam, Adediran Adesina, Gambo Aliyu, Gregory Ashefor, Rose Aguolu, Alexandria Reimer, Chantal Munyuza, Rayeil J. Chua, Xuefen Yang, Leigh M. McClarty, Shajy Isac, Faran Emmanuel, James Blanchard, Paul Sandstrom, Hezhao Ji, Marissa Becker, Souradet Y. Shaw, François Cholette

Notice bibliographique

RevueJAIDS Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV/AIDS drug development and treatment
Établissements canadiensUniversity of ManitobaPublic Health Agency of CanadaManitoba Health
Organismes subventionnairesCanada Research ChairsGlobal Fund to Fight AIDS, Tuberculosis and Malaria
Mots-clésKey (lock)Human immunodeficiency virus (HIV)Drug resistanceEfavirenzResistance (ecology)Public health surveillanceDrug

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: HIV drug resistance mutations (DRMs) undermine the effectiveness of antiretroviral therapy (ART) and can lead to treatment failure. This study aimed to characterize HIV drug resistance among key populations in Nigeria. DESIGN: A cross-sectional integrated biological and behavioral surveillance survey was conducted across 6 Nigerian geopolitical zones among female sex workers, men who have sex with men, people who inject drugs, and transgender individuals (August-December 2020). METHODS: Dried blood spot specimens were collected from 2309 participants, of whom 719 (31.1%) were HIV viremic (>1000 copies/mL). Partial HIV pol genes were sequenced using an in-house genotyping assay. DRMs were identified from MiSeq reads using HyDRA Web and interpreted with Stanford HIVdb. Pearson χ 2 tests assessed associations between sociodemographic factors and DRMs. RESULTS: Among 414 HIV genotyped specimens, 16.7% contained at least 1 DRM. Common DRMs included K103N, M41L, and M184V, with 9.2% showing high-level resistance to efavirenz and nevirapine. DRM prevalence was highest among people who inject drugs (21.6%) and residents of the North Central zone (25.8%). Age was significantly associated with DRMs ( P < 0.001). Notably, 58.7% of participants were unaware of their HIV-positive status and had never received ART. CONCLUSIONS: The presence of DRMs among ART-naive participants suggests transmitted drug resistance. The association between older age and DRMs may reflect suboptimal adherence, prior regimen exposure, or longer treatment. High-level resistance to efavirenz supports transitioning to dolutegravir-based first-line regimens and highlights the importance of supporting key populations in accessing and adhering to ART to prevent the spread of drug-resistant HIV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,048

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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