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Enregistrement W4414138047 · doi:10.3389/fimmu.2025.1497766

SIFD-associated TRNT1 deficiency unveils importance of TSPO during macrophage antibacterial and antiviral responses

2025· article· en· W4414138047 sur OpenAlexafffund
Duale Ahmed, Angelo Slade, Thet Fatica, Stephen Baird, Krishna Bhattarai, Thérèse Atallah, Edana Cassol, Martin Holčı́k

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern OntarioCarleton University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCarleton University
Mots-clésMacrophageImmune systemReprogrammingCytokineMitochondrionInflammation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Mitochondria support cellular biosynthetic and bioenergetic demands and mediate cell signaling. Their dysfunction is implicated in a wide range of diseases, including congenital disorders. One such disorder, sideroblastic anemia with B-cell immunodeficiency, periodic fevers, and developmental delay (SIFD), is caused by mutations in the tRNA-nucleotidyltransferase enzyme TRNT1. While SIFD is known to affect immune function, the role of macrophages-key mediators between innate and adaptive immunity-remains underexplored. Methods: To investigate the impact of TRNT1 deficiency on macrophage function, we employed siRNA-mediated knockdown of TRNT1 in murine RAW264.7 macrophages. Cells were stimulated with lipopolysaccharide (LPS) and Polyinosinic:polycytidylic acid (Poly (I:C)) to mimic bacterial and viral infections, respectively. Cytokine production was measured, and mitochondrial reprogramming was assessed. Bioinformatic analysis was conducted to identify TRNT1-dependent transcripts, focusing on mitochondrial-associated proteins. Functional rescue experiments were performed using TSPO ligands and TSPO overexpression. Results: TRNT1 knockdown impaired inflammatory cytokine production in response to both LPS and Poly (I:C). This correlated with diminished mitochondrial reprogramming, suggesting a mechanistic link between TRNT1 activity and macrophage effector function. Transcriptomic analysis identified the mitochondrial translocator protein (TSPO) as a TRNT1-dependent gene. TSPO expression was differentially regulated following stimulation in TRNT1-deficient cells. While TSPO ligand activation failed to restore cytokine production, TSPO overexpression prior to TRNT1 knockdown selectively rescued the inflammatory response to Poly (I:C), but not LPS. This rescue was associated with enhanced recruitment of VDAC to the mitochondrial permeability transition pore via TSPO. Discussion: Our findings reveal that TRNT1 is critical for pathogen-specific mitochondrial reprogramming in macrophages, influencing their inflammatory capacity. The differential restoration of cytokine responses via TSPO overexpression underscores the complexity of mitochondrial signaling in immune regulation. These insights suggest that targeting mitochondrial pathways may offer a novel therapeutic strategy for managing immunodeficiency in SIFD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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