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Enregistrement W4414146401 · doi:10.1002/ajmg.a.64242

De Novo Truncating Variants in <scp> <i>ZNF865</i> </scp> Cause a Novel Neurodevelopmental Disorder

2025· article· en· W4414146401 sur OpenAlexaff
Samuel M Bradbrook, Gail E. Graham, Melissa T. Carter, Maria Kibæk, Christina Fagerberg, Martin J. Larsen, Katherine Dawson, Cheryl Meuter, Alexander Pepler, Thomas Besnard, Marie Vincent, Bertrand Isidor, Stéphane Bezieau, Benjamin Cogné, Kathrine Bjørgo, Silja Svanstrøm Amundsen, Thomas Courtin, Lisa Emrick, Jill A. Rosenfeld, Monika Weisz‐Hubshman, Bryan C. Mak, Julián A. Martínez-Agosto, Mathilde Heulin, Gilles Morin, Boris Keren, Sacha Schutz, Pauline Monin, Mathilde Pujalte, Louis Januel, Gaëtan Lesca, Marie‐Noëlle Bonnet‐Dupeyron Valence, Henri Margot, Jonathan Lévy, Emmanuela Iovino, Federica Isidori, Tommaso Pippucci, Francesca Montanari, Lauren Bell, Jennifer Burton, Erin Torti, Ingrid M. Wentzensen, Julien Marcadier

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern OntarioAlberta Children's Hospital
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentIntellectual and Developmental Disabilities Research CenterNational Institutes of Health
Mots-clésExome sequencingZinc fingerGeneExomePhenotypeGenomeDNA sequencingHuman genomeNeurodevelopmental disorder

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Despite significant knowledge advances in recent decades, the role of most protein-coding genes in human disease remains incompletely understood. Exome sequencing continues to improve our understanding by elucidating novel genotype-phenotype associations. Across multiple healthcare centers, either exome or genome sequencing was performed in 18 patients with shared features of global developmental delay, hypotonia, and dysmorphisms. De novo, truncating variants in ZNF865 were identified in all 18 patients, with all but one clustered toward the C-terminus. Four variants were seen more than once in unrelated patients. No disease-causing variants were identified in other genes that would explain the patients' phenotypes. Little is known of the function of ZNF865, which belongs to the poly-zinc finger family of proteins that contain a large array of tandem C2H2 zinc finger DNA binding domains. Our findings suggest that protein-truncating variants in this gene lead to intellectual disability with a recognizable phenotypic pattern.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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