MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4414147262 · doi:10.7717/peerj.20019

The potential biofertilization effect of H<sub>2</sub> is accompanied by a modest impact on the composition of microbial communities in the rhizosphere of common vetch

2025· article· en· W4414147262 sur OpenAlexafffund
Diana Patricia Dip, Philippe Constant

Notice bibliographique

RevuePeerJ · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésRhizosphereNutrientBiomass (ecology)Composition (language)Abundance (ecology)Soil nutrientsRelative species abundance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background N2-fixing nodules release molecular hydrogen (H2) in the rhizosphere of legumes. The process activates H2-oxidizing bacteria (HOB) in soil, leading to multiple effects on biogeochemical processes and a potential biofertilization effect. The legacy effect of the energy potential of H2 on the soil microbial community structure and the population density of HOB has received little attention. The aim of the current study is to evaluate how the legacy effect of HOB, previously activated in soil microcosms exposed to elevated H2 concentrations (eH2), affects biomass production yield of common vetch (Vicia sativa), the abundance of HOB, and the composition of the rhizosphere microbiome. Methods Contrasting soil samples displaying more than 60% difference in H2 oxidation activity were used as growth substrate for vetch. Soil microbial community composition and diversity were examined by bacterial 16S rRNA polymerase chain reaction (PCR) amplicon sequencing, and dry weight (DW) of the above- and below-ground biomass of vetch was analyzed to assess the impact of HOB enrichment on plant growth. The population density of high-affinity HOB was estimated by using the droplet digital polymerase chain reaction (ddPCR) technique to target the hhyL gene, encoding for the large subunit of group 1H/5 [NiFe]-hydrogenase. Results The abundance of HOB possessing group 1H/5 [NiFe]-hydrogenase was indistinguishable between the treatments, indicating that soil nutrient content (inorganic and organic carbon) and the energy potential of H2 were insufficient to support their growth. Aeromicrobium spp. and Ramlibacter spp. were favored by eH2 exposure at the activation stage, but their response was lost after vetch growth. The root biomass and the root/shoot ratio were reduced in soil conditioned with eH2 compared to control soil exposed to ambient H2, suggesting that the plant growth-promotion activity of HOB reduces root proliferation for nutrient prospection. These results provide new experimental evidence suggesting the biofertilization effect of H2 is not universal and requires specific conditions that are yet to be identified.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePeerJMême sujetLegume Nitrogen Fixing SymbiosisTravaux en français237 207