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Enregistrement W4414159440 · doi:10.1128/aem.01238-25

The cell surface-associated rhamnose-glucose polysaccharide represents the receptor of <i>Streptococcus thermophilus</i> bacteriophage P738

2025· article· en· W4414159440 sur OpenAlexaff
Zoe Kampff, Irina Sadovskaya, Evgeny Vinogradov, Brian McDonnell, Douwe van Sinderen, Jennifer Mahony

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensNational Research Council CanadaInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesScience Foundation Ireland
Mots-clésBacteriophageStarterPolysaccharideBacteriaIndustrial microbiologyFermentationReceptorBacterial cell structure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Streptococcus thermophilus is a key lactic acid bacterial species extensively used in dairy fermentations, where bacteriophage (phage) infections pose a significant threat to production efficiency. While the cell surface receptors for four of the five currently known streptococcal phage genera have previously been identified, the specific host-encoded receptor for the P738 phage group has not been elucidated to date. In this study, P738 bacteriophage-insensitive mutants of S. thermophilus UCCSt50 were isolated, and whole-genome sequencing revealed mutations in a glycosyltransferase-encoding gene within the rgp locus, responsible for the biosynthesis of the cell wall-associated r hamnose- g lucose p olysaccharide (RGP). Compositional and methylation analysis demonstrated that loss of a terminal rhamnose residue from the RGP side chain underpinned the observed resistance to P738 binding and infection. Fluorescent binding assays validated the biological functionality of the predicted receptor binding protein of P738, confirming the critical role of the RGP side chain in phage adsorption. These findings reveal a strict requirement for a complete tetrasaccharide side chain structure for P738 binding, contrasting with the less stringent requirements observed for the Brussowvirus SW13. This work offers valuable insights to guide the development of phage-robust starter cultures through knowledge-based strain selection and rotation strategies, thereby supporting more sustainable and reliable dairy fermentation processes. IMPORTANCE Streptococcus thermophilus is one of the most extensively applied members of the lactic acid bacteria, being extensively used as a bacterial starter culture in the production of fermented foods, including cheeses and yogurt. Bacteriophage infections present a significant threat to industrial dairy fermentations, which can lead to substandard production processes and product quality. Understanding phage-host interactions, which commence with the recognition and binding of a given bacteriophage to a particular host-encoded, cell surface-associated receptor, is essential for developing strategies to minimize phage-related risks in dairy fermentations. This study identifies the specific cell surface polysaccharide structure produced by Streptococcus thermophilus as the receptor required for infection by phage P738, bridging a key knowledge gap in phage-host interactions in this important industrial bacterial species. By elucidating how phage P738 recognizes and binds to its host, this work offers valuable information to aid strain selection and the development of phage-robust starter cultures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,002
Tête enseignante GPT0,178
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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