Abundance of <i>Bifidobacterium</i> species in the infant gut microbiota and associations with maternal-infant characteristics in Dhaka, Bangladesh
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT The early infant gut microbiota is generally dominated by bifidobacteria, but there is substantial variation at the (sub)species level. Patterns of postnatal Bifidobacterium subspecies colonization in low- or middle-income countries have not been widely studied. We used (sub)species-specific qPCR to quantify B. infantis ( n = 1132) , B. longum ( n = 364), and B. breve ( n = 399) in stool samples from infants (0–6 months of age) in urban Dhaka, Bangladesh. B. infantis absolute abundance started low at birth but increased in the first two months, whereas B. longum and B. breve abundances remained comparatively low. B. infantis emerged earlier in infants delivered by C-section, but by ~2 months of age, infants delivered by C-section or vaginally had similar B. infantis absolute abundances. Infant antibiotic exposure (ever vs. never), human milk feeding patterns (exclusive, predominant, and partial), and detection of maternal stool B. infantis were not associated with infant B. infantis . In settings where B. infantis is widespread, its patterns of postnatal colonization can be used to inform the design of targeted microbiota-modifying interventions in infancy. IMPORTANCE Bifidobacteria are considered to be an important member of the early infant gut microbiota, but several factors may influence the timing of their emergence and overall abundance. Moreover, bifidobacteria abundance varies considerably between different species and subspecies, underscoring the importance of techniques that enable sub-speciation. B. longum subspecies infantis ( B. infantis ) is thought to have several health-promoting properties, and despite growing interest in the use of B. infantis to promote health (e.g., probiotics), relatively few studies have explored its natural patterns of colonization, particularly in low- and middle-income countries. By applying (sub)species-specific qPCR, we precisely tracked the timing of emergence, longitudinal abundance patterns, and ecological dynamics of B. infantis , B. longum , and B. breve in the postnatal period, which provided new insights to inform the design of targeted microbiota-modifying interventions in early infancy.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».