MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4414168152 · doi:10.1128/msphere.00314-25

Abundance of <i>Bifidobacterium</i> species in the infant gut microbiota and associations with maternal-infant characteristics in Dhaka, Bangladesh

2025· article· en· W4414168152 sur OpenAlexafffund
Aline C. Freitas, Grace Li, Jakaria Shawon, Huma Qamar, Lisa G. Pell, Mamun Kabir, Ovokeraye H. Oduaran, Scarlett Puebla-Barragan, Diego G. Bassani, Karen M O’Callaghan, Jennifer C. Onuora, Miranda G. Loutet, Cole Heasley, Cody W. E. Starke, Abdullah Al Mahmud, Davidson H. Hamer, Eleanor Pullenayegum, Mohammad Iqbal Hossain, Md Muniruzzaman Siddiqui, Mohammad Shahidul Islam, Philip M. Sherman, Prakesh S. Shah, S. M. Abdul Gaffar, Shamima Sultana, Shaun K. Morris, Tahmeed Ahmed, Mohammad Rashedul Haque, Shafiqul Alam Sarker, Daniel Roth

Notice bibliographique

RevuemSphere · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of TorontoInstitute for Clinical Evaluative SciencesSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesUniversity of California, San DiegoInternational Centre for Diarrhoeal Disease Research, BangladeshHospital for Sick ChildrenBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésAbundance (ecology)ColonizationGut floraSubspeciesFecesRelative species abundance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The early infant gut microbiota is generally dominated by bifidobacteria, but there is substantial variation at the (sub)species level. Patterns of postnatal Bifidobacterium subspecies colonization in low- or middle-income countries have not been widely studied. We used (sub)species-specific qPCR to quantify B. infantis ( n = 1132) , B. longum ( n = 364), and B. breve ( n = 399) in stool samples from infants (0–6 months of age) in urban Dhaka, Bangladesh. B. infantis absolute abundance started low at birth but increased in the first two months, whereas B. longum and B. breve abundances remained comparatively low. B. infantis emerged earlier in infants delivered by C-section, but by ~2 months of age, infants delivered by C-section or vaginally had similar B. infantis absolute abundances. Infant antibiotic exposure (ever vs. never), human milk feeding patterns (exclusive, predominant, and partial), and detection of maternal stool B. infantis were not associated with infant B. infantis . In settings where B. infantis is widespread, its patterns of postnatal colonization can be used to inform the design of targeted microbiota-modifying interventions in infancy. IMPORTANCE Bifidobacteria are considered to be an important member of the early infant gut microbiota, but several factors may influence the timing of their emergence and overall abundance. Moreover, bifidobacteria abundance varies considerably between different species and subspecies, underscoring the importance of techniques that enable sub-speciation. B. longum subspecies infantis ( B. infantis ) is thought to have several health-promoting properties, and despite growing interest in the use of B. infantis to promote health (e.g., probiotics), relatively few studies have explored its natural patterns of colonization, particularly in low- and middle-income countries. By applying (sub)species-specific qPCR, we precisely tracked the timing of emergence, longitudinal abundance patterns, and ecological dynamics of B. infantis , B. longum , and B. breve in the postnatal period, which provided new insights to inform the design of targeted microbiota-modifying interventions in early infancy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,538
Score d'incertitude au seuil0,350

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuemSphereMême sujetGut microbiota and healthTravaux en français237 207