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Enregistrement W4414199129 · doi:10.1371/journal.pone.0330701

Gene profiles of peripheral white blood cells as potential predictors of pregnancy in embryo-recipient heifers

2025· article· en· W4414199129 sur OpenAlexfundno aff
Mariam Raliou, M. Meyerholz, Doulaye Dembélé, Kirsten Mense, Maike Heppelmann, Christophe Richard, Pascale Chavatte-Palmer, Isabelle Dieuzy-Labaye, David G. Smith, Peter Zieger, Hans‐Joachim Schuberth, Marion Schmicke, I. Martin Sheldon, Olivier Sandra

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive System and Pregnancy
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDirectorate for Biological SciencesInstitut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement
Mots-clésConceptusEmbryoEstrous cycleEmbryo transferPregnancyEndometriumTranscriptomeMicroarray

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The bovine endometrium undergoes cellular, molecular, and functional changes to support embryo survival and development to term. These changes involve a finely coordinated series of events at both local and systemic levels. We postulated that circulating white blood cells (WBCs) could provide valuable biomarkers for predicting pregnancy success in heifers undergoing embryo transfer, when, sampled during both a preconception cycle and a conception cycle, before embryo transfer takes place. WBCs were isolated using PAXgene Blood RNA tubes collected from Holstein-Friesian heifers on Days 7 and 14 of a preconception estrous cycle (PCD7 and PCD14) and, after a rest cycle, on Day 7 of the subsequent estrous cycle (1ETD7) just before embryo transfer. Circulating progesterone and estrogens were assayed and pregnancy was confirmed by either uterine flushing and conceptus collection on Day 18 post-estrus, or the delivery of a healthy calf. Using a custom bovine gene expression microarray representing 19,479 unique transcript, comparison of transcriptomes between heifers classified as non-pregnant or pregnant revealed 1,240, 896 and 1,023 differentially expressed genes (DEGs) at PCD7, PCD14 and 1ETD7 respectively. Our bioinformatics analyses revealed that pregnancy failure after embryo transfer was associated with upstream regulators, biological functions, canonical pathways and gene networks related to inflammation, immunity, apoptosis and cell death regulation, cell proliferation, membrane compounds, lipid metabolism, oxygen transport and ions transport. The heifers classified as non-pregnant showed significant increased transcripts levels of PTGR1 at the three time points (PCD7, PCD14 and 1ETD7), AIF1 at PCD14, FNDC3B, IL15 and SERPINE1 at 1ETD7. Our findings highlight the potential of peripheral WBCs as a non-invasive source of biomarkers for predicting pregnancy outcomes, offering promising insights for improving pregnancy success when reproductive biotechnologies are used in mammalian females.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,057
Score d'incertitude au seuil0,644

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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