Checkpoint-Dependent Sensitivities to Nucleoside Analogues Uncover Specific Patterns of Genomic Instability
Notice bibliographique
Résumé
Nucleoside analogues are used as drugs and as labels in laboratory-based research. However, the effect of different nucleoside analogue mechanism(s) on cell sensitivity or mutagenesis is unclear. This is particularly important in cancer treatments where checkpoint proteins and DNA damage factors are often mutated. We tested six nucleoside analogues in fission yeast, Schizosaccharomyces pombe. We found that the mutations in the DNA replication checkpoint cause unique sensitivity profiles towards chemotherapeutic nucleoside analogues (gemcitabine, 5-fluorouracil, cytarabine) and the non-clinical analogue bromodeoxyuridine. Antiretroviral compounds, zidovudine and lamivudine, did not alter cell growth. We compared half-maximal inhibitory concentration (IC50) doses between checkpoint deficient yeast strains, examining culture growth and DNA mis-segregation. Intriguingly, gemcitabine and bromodeoxyuridine doses above the IC50 promoted better growth. Above each compound’s IC50 dose we saw that cells were insensitive to nucleoside analogue re-exposure, particularly in DNA replication checkpoint mutants (cds1∆, rad3∆). Thus, pairing nucleoside analogue use with personal genomics may inform drug choice, dose, and schedule. Finally, these data indicate that resistance may be predictable, informing clinical strategy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».