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Enregistrement W4414207475 · doi:10.12688/openreseurope.20658.2

ERGA-BGE genome of the Spanish moon moth Actias isabellae Graells, 1849: a nocturnal lepidopteran protected by the Habitats Directive

2025· article· en· W4414207475 sur OpenAlexaff
Marta Vila, Neus Marí‐Mena, Roger Vila, Ana Riesgo, Daniel García‐Souto, Carlos López‐Vaamonde, Astrid Böhne, Rita Monteiro, Thomas Marcussen, Rebekah A. Oomen, Torsten H. Struck, Marta Gut, Laura Aguilera, Francisco Câmara Ferreira, Fernando Cruz, Jèssica Gómez‐Garrido, Tyler Alioto, Leanne Haggerty, Fergal J. Martin, Chiara Bortoluzzi

Notice bibliographique

RevueOpen Research Europe · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLepidoptera: Biology and Taxonomy
Établissements canadiensSaint John Regional HospitalUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesAgencia Estatal de InvestigaciónStaatssekretariat für Bildung, Forschung und InnovationHORIZON EUROPE Framework ProgrammeUniversidade da CoruñaGeneralitat de CatalunyaXunta de GaliciaEuropean Regional Development FundUK Research and Innovation
Mots-clésGenomeGenomicsReference genomePopulationHabitats DirectiveSequence assemblyBiodiversity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High-quality reference genomes are critical resources for understanding biodiversity and supporting conservation efforts. We present the chromosome-level assembly of the Spanish moon moth, Actias isabellae (Graells, 1849), a nocturnal lepidopteran protected under the EU Habitats Directive. The assembly spans 0.56 Gb across 31 pseudomolecules, including the Z chromosome, with a contig N50 of 18.9 Mb and a scaffold N50 of 20.4 Mb. The mitochondrial genome was also assembled into a 15,247 bp circular sequence. Annotation identified 11,805 protein-coding genes and 2,238 non-coding genes, with a BUSCO completeness of over 94%. Notably, no W chromosome was detected, suggesting a ZZ/Z0 sex determination system. This reference genome provides an essential foundation for studying sex chromosome evolution in Lepidoptera and enables advanced population genomics monitoring of this protected species. More broadly, it contributes to ongoing efforts within the European Reference Genome Atlas and the Earth BioGenome Project to harness genomics for biodiversity conservation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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