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Enregistrement W4414238166 · doi:10.1111/gwmr.70011

Field‐Scale <scp>qPCR</scp> Data to Estimate Rate Constants for Toluene Biodegradation in Groundwater

2025· article· en· W4414238166 sur OpenAlexfundno aff
Giovanni Pilloni, John T. Wilson, Sam Rosolina, Benjamin Oyston, Dora Taggart, Trent A. Key

Notice bibliographique

RevueGroundwater Monitoring & Remediation · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueRadioactive element chemistry and processing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of Toronto
Mots-clésBiodegradationGroundwaterReaction rate constantTolueneBenchmark (surveying)Bioremediation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Biodegradation of petroleum hydrocarbons in groundwater occurs naturally and can be enhanced to support contaminated site management and remediation. Molecular biological tools can be used to assess the occurrence of biodegradation and monitor bioremediation efforts; however, the use of specific genes (i.e., biomarkers) to identify the rate constants of contaminant removal has not been explored for monoaromatic hydrocarbons. In this study, an approach was developed to estimate an apparent first‐order rate constant for anaerobic biodegradation of toluene based on toluene concentration and the abundance of the alpha subunit of the benzylsuccinate synthase gene (i.e., bssA ). The utility of the approach was evaluated by comparing the distribution of estimated rate constants to those from a published compilation at benchmark sites. There was good agreement between the distribution of rate constants calculated from the abundance of gene copies from soil cores and the distribution of rate constants at benchmark sites, while rate constants calculated from the abundance of gene copies in groundwater were lower than those from the benchmark sites. Given that groundwater samples are more common and convenient to obtain, it is proposed to use the rate constants estimated from groundwater samples to document whether the microbial community has acclimated for biodegradation of toluene. When practitioners use models to evaluate risk at petroleum release sites, they often assume a “typical” rate constant for biodegradation. If the abundance of the bssA biomarker demonstrates that the microbial community has acclimated, then it is appropriate to select and use a rate constant from benchmark sites to forecast biodegradation and attenuation of toluene at a site being evaluated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,178
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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