Evolutionary History of the Endangered Sanje Mangabey (Cercocebus sanjei) in the Udzungwa Mountains, Tanzania: Inferences from Phylogeography and Historical Niche Modelling
Notice bibliographique
Résumé
Understanding whether a species' distribution results from recent and/or anthropogenic events or ancient vicariant factors is critical for conservation planning. The Endangered Sanje mangabey (Cercocebus sanjei), endemic to Tanzania's Udzungwa Mountains, is currently divided into two populations located approximately 100 km apart. These represent distinct evolutionary lineages that diverged around 0.77 million years ago (MYA). We aimed to investigate i) the phylogeographic history and recent changes in size and range of the two Sanje mangabey populations, and ii) whether lack of suitable habitat between populations and consequent difficulty to disperse may have influenced the 0.77 MYA divergence time. We used 64 mitochondrial control region sequences obtained from non-invasive DNA. The probability of suitable habitat across Tanzania and the Udzungwa Mountains was modelled at three time points: Mid-Holocene (6,000 YA), Last Glacial Maximum (22,000 YA), and the Last Interglacial period (120,000-140,000 YA). We found six haplotypes, clustered into two haplogroups. Significant differentiation was estimated between populations, which show no evidence for recent range expansion or contraction. The ecological niche modelling revealed fluctuating extents of suitable habitat across southern Tanzania. Large genetic differentiation between populations may have been influenced by a general trend in aridification in East Africa across the last 40,000 years, resulting in a shift of montane forests to gradually higher elevations. Intermediate populations may have become extinct as suitable habitat retracted, leaving relict populations with relatively stable demographic histories ancestral to the present-day populations. This study supports their preliminary designation as separate evolutionary significant units, a conclusion with conservation management implications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».