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Enregistrement W4414259741 · doi:10.1101/2025.09.12.675941

Peptidoglycan turnover promotes active transport of protein through the bacterial cell wall

2025· preprint· en· W4414259741 sur OpenAlexaff
Zarina Akbary, Dan Shafir, Glen M. Hocky, Sven van Teeffelen, Enrique Rojas

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésPeptidoglycanBacterial cell structureCell wallLipid IISecretionCellTransport proteinCell membranePhospholipase A2

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The bacterial cell wall is a critical load-bearing structure, but is not thought to be an important permeability barrier since proteins freely diffuse through isolated cell wall sacculi and bacteria secrete proteins without the aid of any known channels or transporters in the wall. Using new genetically encoded probes to measure the permeability of the cell in situ at the single-cell level, we discovered that the size threshold determining whether proteins can pass through the Bacillus subtilis sacculus is smaller than was previously thought. We found that transport of small proteins (<10 kDa) through the sacculus was consistent with passive diffusion through discrete pores, while larger proteins (>15 kDa) required the generation of larger pores by inducing peptidoglycan hydrolysis unbalanced by synthesis. These data are consistent with physics-based models of diffusion through a random percolation network of finite thickness. Conversely, the ability of the innate immune factor phospholipase (15.2 kDa) to kill B. subtilis was inhibited by membrane de-polarization. The protective effect of de-polarization was dependent on latent peptidoglycan synthesis (decoupled from cell growth) by PBP1 – highlighting a new role for this enzyme – and on reduced peptidoglycan hydrolysis. These results demonstrate that the rapid peptidoglycan turnover that drives cell growth also promotes movement of phospholipase across the cell wall, identifying a quintessentially bacterial mechanism of active transport. Significance Statement Gram-positive bacteria, which include many serious pathogens like Staphylococcus aureus , Listeria monocytogenes , and Clostridium difficile , are defined by their thick peptidoglycan cell wall. Here, we demonstrate that this structure is a critical permeability barrier that blocks antibacterial proteins like those used by the human innate immune system. Furthermore, this barrier function depends on the physiological state of the cell: the wall of non-growing cells is less permeable because peptidoglycan turnover during growth actively promotes transport of specific proteins through the cell wall. This prokaryotic paradigm for molecular transport has important implications for host-pathogen interactions since pathogenic bacteria often assume both non-growing and growing states during infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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