Nucleic Acid FRET Sensing of Hydrogen Peroxide in Live Cells Using a Boronic Acid Nucleobase Surrogate
Notice bibliographique
Résumé
For activity-based sensing, where probes detect biological analytes through chemical reactivity, nucleic acid (NA) scaffolds are seldom employed. Herein, we present the first all-in-one NA sensor (KR28) that is activated by H2O2 as a molecular trigger to foster a turn-on FRET response in human serum and in the nucleus of live cells. The 28-mer 2ʹ-OMe-XNA hairpin (HP) KR28 features a boronic acid nucleobase surrogate (BA6HI) that serves as the H2O2 sensing element and is embedded into KR28 using an on-strand Aldol condensation approach. Ipso-hydroxylation of the BA6HI surrogate mediated by H2O2 furnishes an emissive phenolic product (PhOH6HI, λex/λem = 390/490 nm) that serves as the FRET donor to a thiophene surrogate acceptor (Th6HI, λex/λem = 530/580 nm) for a FRET efficiency of 95%. The BA6HI-modified NA scaffolds match the sensitivity of free boronic acid dyes for H2O2 (~ 150 nM) and localize in the nucleus of live cells for nuclear H2O2 FRET detection. Our work expands the function of NA scaffolds beyond their use as molecular recognition elements and demonstrates their potential to serve as activity-based sensors of ROS to probe the relationships between nuclear oxidative stress and disease states.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».