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Enregistrement W4414277980 · doi:10.1101/2025.09.12.675841

Stable isotope tracer captures the anabolic response of human skeletal muscle microtissues undetected by puromycin labeling

2025· preprint· en· W4414277980 sur OpenAlexafffund
Yekaterina Tiper, Cassidy T. Tinline‐Goodfellow, Penney M. Gilbert, Daniel R. Moore

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle metabolism and nutrition
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanada First Research Excellence FundUniversity of Toronto
Mots-clésMyofibrilSkeletal muscleMyocyteMyogenesisSarcoplasmPuromycinAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Skeletal muscle microtissues are valuable in vitro models for studying the stimuli regulating muscle protein synthesis (MPS), the key determinant of changes in muscle mass. Differentiated between opposing posts, microtissues contain aligned, contractile myotubes, providing a controlled system for investigating the responses of skeletal muscle to nutrient and contractile stimulation. However, microtissue MPS responses to these stimuli remain under-characterized. Stable isotope-labeled amino acid tracers deliver sarcoplasmic and myofibrillar fractional synthetic rates (FSR) for MPS in human studies, but have not been implemented in engineered skeletal muscle. We close these gaps by characterizing stimulation-induced MPS, in microtissues and 2D myotubes derived from the same primary myoblast line, using stable isotope tracers and puromycin incorporation. In microtissues, sarcoplasmic FSR increased significantly during the two-hour period following amino acid treatment ( p < 0.0001), whereas myofibrillar FSR remained unchanged ( p = 0.159). However, both fractions were unresponsive to ketone stimulation and contraction (all p ≥ 0.703). 2D myotubes showed significant increases in sarcoplasmic and myofibrillar FSR in response to amino acid treatment (both p = 0.002). Notably, microtissues demonstrated a more stable myofibrillar protein fraction, with a sarcoplasmic-to-myofibrillar FSR ratio of ∼2:1 which closely resembled that of native human muscle. The puromycin-based approach failed to detect MPS responses to any stimulus (all p ≥ 0.677), highlighting the superior sensitivity of tracer-based measurements, particularly where longer timescales are needed to capture an effect. These findings support the use of engineered muscle and isotope-derived measurements of MPS in future studies of stimuli regulating skeletal muscle mass. New Findings What is the central question of this study? Stable isotope tracers are emerging as a powerful approach to measure fraction-specific protein synthesis. However, their efficacy relative to conventional puromycin labeling remains unreported, and they have not been applied to engineered skeletal muscle. What is the main finding and its importance? By implementing stable isotope tracers in engineered muscle, we showcase the ability to capture anabolic responses that are undetected by puromycin-based methods. We found that the myofibrillar protein fraction of microtissues is more stable than the sarcoplasmic fraction, a property of native muscle, absent in 2D myotubes. These findings demonstrate the physiological relevance of engineered muscle and support the adoption of isotope-derived measurements in future studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
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