An automated morphometric approach to evaluate distal lung patterning in mouse models of bronchopulmonary dysplasia
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Chronic respiratory diseases represent a large group of non-communicable diseases that are a leading cause of mortality and morbidity globally. Many of the methods utilized to assess airway simplification in experimental models of the conditions are overly time-consuming and are sensitive to inter-operator biases, necessitating the need for unbiased and efficient tools to supplement analyses. Methods We propose a semi-automated method to quantitate the characteristics of large terminal respiratory airways and alveoli that uses free image-processing software (Fiji). We aimed to develop and test this method in a mouse model of bronchopulmonary dysplasia (BPD), a disease of blunted airway and pulmonary vascular development that remains a leading cause of mortality among preterm infants. Optimal macro parameters were determined with a test set of images from postnatal day 14 (P14) mice exposed to acute postnatal hyperoxia by determining which area and circularity values best correlated with mean linear intercept (L M ). Validation was performed on a separate set of images from P7 mice subjected to the same hyperoxic model of BPD. Results Both alveolar duct (r: 0.7866, p = 0.0359) and alveolar (r: 0.9475, p = 0.0012) area correlated with L M measurements from the test set. Using our method on a validation dataset, we demonstrate that hyperoxia-exposed mice possess fewer, enlarged alveoli that occupy less total area, as well as enlarged alveolar ducts that occupy a greater proportion of the parenchyma. Conclusions We report a semi-automated method of quantitating the characteristics of large and small terminal respiratory airways. This tool expedites analysis and removes operator bias relative to existing methods. We also demonstrate that L M changes in the acute hyperoxia-induced BPD model result from both alveolar simplification and inadequate primary septation at the level of the alveolar ducts.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».