The role of <i>Akkermansia muciniphila</i> sulfatases in colonic mucin utilisation
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Akkermansia muciniphila , an obligate mucin degrader, is a major member of the human colonic microbiota and has been associated positive health outcomes. Mucins are complex glycoproteins that contain heavily sulfated O -glycans and form the protective colonic mucus layer. Bacterial carbohydrate sulfatases are required to metabolise these heavily sulfated mucin glycans and excessive bacterial foraging has been associated with several diseases. Sulfatases have been linked with inflammatory bowel disease, making these microbiota enzymes potential drug targets. A. muciniphila expresses carbohydrate sulfatases that can act on colonic mucins yet their roles in its metabolism remain opaque. Our data reveal that A. muciniphila requires glycopeptides/protein forms of colonic mucin for metabolism and its sulfatases have unique adaptations compared to Bacteroides species. Localisation studies reveal that desulfation of N -acetyl-D-glucosamine, but not D-galactose, is exclusively periplasmic. A cell surface sulfatase has a novel carbohydrate binding module that binds to colonic mucin. This paints a contrasting picture of sulfated mucin metabolism by Akkermansia muciniphila versus Bacteroides species. These data will be important for understanding the contexts for Akkermansia muciniphila ’s positive health correlations.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».