The Omp85 family protein, TamA, exhibits characteristics of a suitable drug target against <i>Pseudomonas aeruginosa</i>
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT The outer membrane (OM) of Gram-negative bacteria is crucial for cell stability and virulence and acts as a permeability barrier. The biogenesis, assembly, and regulation of proteins in the OM are therefore attractive areas of study that could lead to identifying novel drug targets. The Translocation and Assembly Module (TAM), composed of TamA and TamB, facilitates the insertion of some β-barrel proteins into the OM of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae , and has also been implicated in lipid homeostasis. However, its role in Pseudomonas aeruginosa remains mostly uncharacterized. To investigate the TAM’s function and drug target potential in P. aeruginosa , we generated both single- and double-gene TAM knockouts and assessed their fitness using competition growth assays against wild-type (WT) strains. The WT significantly outcompeted the TAM mutants, indicating a fitness defect. Proteomic analysis revealed surprisingly similar profiles between WT and the double knockout strains, while single knockouts showed changes in OM proteins and reduced expression of flagellar components consistent with attenuated swimming motility observed in Δ tamA . Single mutants exhibited differential levels of expression of lipoproteins of the β-barrel assembly machinery suggesting compensatory OM remodelling. In vivo infection assays using Galleria mellonella larvae demonstrated significantly higher survival rates when infected with TAM mutants, with tamA mutants showing the greatest attenuation in virulence. Our findings demonstrate a role the TAM plays in P. aeruginosa virulence and identify TamA as a potential drug target for the development of new antimicrobial therapies. Data summary The RNAseq data reported on in this article are available from ArrayExpress: E-MTAB-15348 The mass spectrometry proteomics data have been deposited to the ProteomeXchange with the dataset identifier PXD06704.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».