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Enregistrement W4414303775 · doi:10.1101/2025.09.10.675406

Development of a chemical probe to enable characterization of the casein kinase 1γ subfamily

2025· preprint· en· W4414303775 sur OpenAlexafffund
Jacob L. Capener, Thomas Krämer, Frances M. Bashore, E Flory, F. Li, Blair L. Strang, Alison D. Axtman

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePhytase and its Applications
Établissements canadiensStructural Genomics ConsortiumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesSt. George's, University of LondonGenentechUNC Eshelman School of Pharmacy, University of North Carolina at Chapel HillOntario Genomics InstituteEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsMerck KGaANational Institutes of HealthOntario GenomicsGenome CanadaFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloMcGill UniversityNorth Carolina Biotechnology CenterPharmaceutical Research and Manufacturers of America FoundationBayerPfizer
Mots-clésSubfamilyKinaseCasein kinase 1Wnt signaling pathwaySignal transductionProtein kinase ACasein kinase 2

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The casein kinase 1γ (CK1γ) subfamily, while severely understudied, is implicated in diverse disease-relevant pathways, including WNT signaling and human cytomegalovirus (HCMV) replication. While genetic tools exist to study CK1γ, the selective inhibition of CK1γ through pharmacological means remains underexplored. Chemical probes, or potent and selective inhibitors, remain one of the most powerful pharmacological tools for uncovering protein biology. Herein, we developed several novel assays for assessing target engagement with the CK1γ subfamily in cells. Enabled by these assays, we conducted a comprehensive structure-activity relationship (SAR) campaign to develop the first chemical probe, SGC-CK1γ-1, for the CK1γ subfamily. SGC-CK1γ-1, which was developed alongside a structurally related negative control compound, potently and selectively inhibited the CK1γ kinases in living cells, plus inhibited both WNT signaling and human cytomegalovirus replication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,125
Score d'incertitude au seuil0,373

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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