Genetics of Sleepwalking: Insights from whole exome sequencing
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Sleepwalking (SW) is a sleep disorder that belongs to the non-rapid eye movement (NREM) sleep family of parasomnias. Although linkage analyses in large families suggest that some forms of SW may follow a monogenic inheritance pattern, the genetic basis of SW has not been thoroughly investigated. The objective of this study was to investigate the role of rare genetic variants in sleepwalking by performing whole-exome sequencing (WES) in two independent cohorts. WES was performed on a cohort of 254 individuals diagnosed with SW (54.7% female, mean age: 39.1 ± 10.7 years) and 124 control individuals were selected based on age and sex (52.4% female, all aged 18 years or older), from Montreal, Canada and Montpellier, France. To be included in the SW group, probands were required to have a primary complaint of SW, undergone at least one night of video-polysomnography, and to experience at least one parasomnia episode per month. By focusing on rare, potentially deleterious genetic variants, defined as having a minor allele frequency (MAF) ≤ 5% and a Combined Annotation Dependent Depletion (CADD) pathogenicity score ≥ 15, WES allowed us to detect novel contributors to the disorder that might be missed in studies focused on common variants. We first identified 99 genes significantly enriched in patients with SW compared to the control group, with 92 genes overlapping between the two clinical cohorts. By prioritizing genes expressed in the brain, we found a strong genetic overlap between the two populations, with 31 genes carrying rare variants in common, including the top 10 genes with the highest contribution to SW compared to controls: NPIPB13, SRRM2, SIRT1, CANT1, DPYSL5, ABCC10, ELF2, DPP9 , RBM28 and MCF2L2 . Results were validated using an independent control cohort from the CARTaGENE database, except for MCF2L2 . The genes NPIPB13 , SRRM2 , and SIRT1 displayed the highest contributions in the population, with values of 13.1%, 7.5%, and 5.5%, respectively. This study represents an important step toward understanding the genetic architecture of sleepwalking, particularly the role of rare coding variants, in sleepwalking and opens new avenues for future research into the disorder’s underlying biological mechanisms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».