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Enregistrement W4414344897 · doi:10.1101/2025.09.15.676399

PIKfyve is an essential component of the endolysosomal pathway within photoreceptors and the retinal pigment epithelium

2025· preprint· en· W4414344897 sur OpenAlexafffund
Kamal A. Attia, Ifrah Anjum, Susanne Lingrell, Matthew D. Benson, Ian M. MacDonald, Jennifer C. Hocking

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversity of AlbertaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesEdmonton Civic Employees Charitable Assistance Fund
Mots-clésRetinal pigment epitheliumEndosomeZebrafishMelanosomeVisual phototransductionRetinaVacuoleRetinal

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Phosphoinositides (PIs) are a family of seven low abundance membrane lipids, each with distinct signaling functions. The phosphoinositide kinase PIKfyve generates phosphoinositide-3,5-bisphosphate (PI(3,5)P₂) and PI5P. Emerging evidence implicates PIKfyve in key cellular processes, including autophagy, phagocytosis, endosomal trafficking, lysosomal maintenance, and melanosome formation. Complete loss of PIKfyve function is embryonic lethal in model organisms. In humans, heterozygous mutations in PIKFYVE are associated with Fleck corneal dystrophy and congenital cataracts. In this study, we investigate the role of PIKfyve in photoreceptors and the adjacent retinal pigment epithelium (RPE), host to dynamic endolysosomal pathways required for enduring the high oxidative stress environment, transporting metabolites and phototransduction components, and the breakdown of outer segment discs. To assess PIKfyve function in the retina and RPE in our zebrafish model, we employed CRISPR/Cas9-mediated gene editing and pharmacological inhibition using the specific PIKfyve inhibitor apilimod. Loss of PIKfyve activity leads to RPE expansion characterized by the accumulation of LC3- and LAMP1-positive vacuoles, along with defects in phagosome degradation and minor changes to melanosome biogenesis. Photoreceptors deprived of PIKfyve function develop a single large vacuole in the inner segment, while the OS remains largely intact over the timespan analyzed. Electroretinography (ERG) recordings revealed complete visual impairment in pikfyve crispant larvae, and significantly reduced visual function in larvae treated with apilimod post embryogenesis. These findings highlight the critical role of PIKfyve in the development and homeostasis of the RPE and retina.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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