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Enregistrement W4414346344 · doi:10.1101/2025.09.18.677162

Hyperspherical geometry positions the lipidome as a partly independent axis of human brain organization

2025· preprint· en· W4414346344 sur OpenAlexaff
Maria Osetrova, Arsenii Onuchin, Elena Stekolshchikova, Philipp Khaitovich, Kirill Polovnikov

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMolecular spectroscopy and chirality
Établissements canadiensOptech (Canada)
Organismes subventionnairesRussian Science Foundation
Mots-clésLipidomeHypersphereHuman brainTranscriptomeOrientation (vector space)Geometric shapePosition (finance)Ellipsoid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The brain’s transcriptome is well mapped, but the spatial organization of lipids—over half of brain dry mass—remains poorly defined. We profiled lipidomic (419 species) and transcriptomic (15,013 genes) signatures from 35 anatomically defined regions in four healthy adult donors, measured from the same tissue samples. Both modalities recapitulate major neuroanatomical divisions, yet the lipidome shows distinctive features: a pronounced white–gray asymmetry, a smooth neocortical rostrocaudal gradient, and limbic-specific lipid clusters absent in transcriptomic space. Using regression against gene-expression principal components and two null models (random and anatomy-aware), we define three data-driven classes of lipid–gene relationships: Synchronizers (10%) tightly coupled to gene programs, Anchors (67%) predictable at levels expected from gross anatomy and cell-type composition, and Drifters (23%) largely transcription-independent. A simple geometric framework unifies these patterns: after centering and normalization, molecular profiles lie on a hypersphere where two interpretable coordinates—polar latitude relative to transcriptome-defined white/gray poles and nearest-gene angular distance—jointly index coupling; an analytical null quantitatively explains the observed scaling. Key effects are robust in leave-one-donor-out analyses and position the lipidome as a partly independent organizational axis of the human brain. Broadly, our results provide an interpretable geometric framework for multi-omics integration, supported by an interactive platform.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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