Blue-shifted ancyromonad channelrhodopsins for multiplex optogenetics
Notice bibliographique
Résumé
Light-gated ion channels from protists (channelrhodopsins or ChRs) are optogenetic tools widely used for controlling neurons and cardiomyocytes. Multiplex optogenetic applications require spectrally separated molecules, which are difficult to engineer without disrupting channel function. Scanning numerous sequence databases, we identified three naturally blue-shifted ChRs from ancyromonads. They form a separate branch on the phylogenetic tree and contain residue motifs characteristic of anion ChRs (ACRs). However, only two conduct chloride, whereas the closely related Nutomonas longa homolog generates inward cation currents in mammalian cells under physiological conditions, significantly exceeding those by previously known tools with similar spectral maxima (peak absorption at ~440 nm). Measurements of transient absorption changes and pH titration of purified proteins combined with mutant analysis revealed the roles of the residues in the photoactive site. Ancyromonad ChRs could be activated by near-infrared two-photon illumination, a technique that enables the deeper-tissue optogenetic activation of specific neurons in three dimensions. Both ancyromonad ACRs allowed optogenetic silencing of mouse cortical neurons in brain slices. Ancyromonas sigmoides ACR ( Ans ACR) expression in cholinergic neurons enabled photoinhibition of pharyngeal muscle contraction in live worms. Overall, our results deepen the mechanistic understanding of light-gated channel function and expand the optogenetic toolkit with potent, blue-shifted ChRs.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».