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Enregistrement W4414360555 · doi:10.1021/acs.jmedchem.5c00459

Comparative Profiling and Chemogenomics Application of Chemical Tools for NR4A Nuclear Receptors

2025· article· en· W4414360555 sur OpenAlexfundno aff
Sabine Willems, Vasily Morozov, Julian A. Marschner, Daniel Merk

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNuclear Receptors and Signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEuropean Research CouncilInnovative Medicines InitiativeHorizon 2020 Framework ProgrammeKungliga Tekniska HögskolanDeutsche ForschungsgemeinschaftEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsDiamond Light SourceMcGill University
Mots-clésNuclear receptorTranscription factorReceptorDrug discoveryEndoplasmic reticulumDrugProfiling (computer programming)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ligand-activated transcription factors of the NR4A family are implicated as promising drug targets with neuroprotective and anticancer potential and attract strong attention in drug discovery. Several NR4A modulators have been described, but a validated set of direct ligands for biological studies is lacking. Here, we profiled the reported and commercially available agonists and inverse agonists under uniform conditions in several orthogonal test systems to establish a highly annotated tool and gain comprehensive insights into the NR4A modulator characteristics. This comparative profiling revealed a lack of on-target binding and modulation for several putative NR4A ligands and validated a set of chemically diverse compounds as direct NR4A modulators for chemogenomics-based target identification studies. Prospective applications unveiled roles of NR4A receptors in endoplasmic reticulum stress and adipocyte differentiation, demonstrating suitability of the set to link the orphan targets with phenotypic effects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,315

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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