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Enregistrement W4414370666 · doi:10.1101/2025.09.17.676869

Large-scale integrative taxonomy of the smallest insects reveals astonishing temperate diversity

2025· preprint· en· W4414370666 sur OpenAlexafffundabout
Catherine Hébert, Colin Favret

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFossil Insects in Amber
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiodiversityTaxonomy (biology)WorkflowTaxonomic rankSpecies diversityDNA barcodingSpecies complexAmbiguity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Fairyflies (Hymenoptera: Chalcidoidea: Mymaridae) are a diverse but taxonomically neglected group of parasitoid wasps that attack eggs of other insects. Being among the very smallest of all insects, they are often overlooked in biodiversity surveys despite being one of the most abundant microhymenoptera in many habitats. The traditional approach of morphological sorting for species delimitation can be challenging due to their minute size and meticulous slide-mounting technique. Ways to accelerate their discovery are needed. We conducted the first large-scale study of Mymaridae in temperate forests, combining DNA megabarcoding and the Large-scale Integrative Taxonomy (LIT) workflow to describe their diversity. We obtained COI barcodes from 2,098 specimens and used ASAP and RESL for species delimitation. Between 42 and 114 molecular clusters were delimited. Reducing morphological validation to only 9% of the sample enabled accurate determination while limiting time and effort. We confirmed the presence of 55 species, including many potentially new to science. The LIT workflow was effective for Mymaridae, although cryptic diversity remains unresolved in some large clusters, especially in the genera Alaptus and Anagrus , where high haplotype diversity and morphological ambiguity suggest additional hidden species. DNA reference databases proved unreliable, with less than 1% correct species matches, highlighting the taxonomic gap for this group. Nonetheless, we contributed 16 new identified reference barcodes to public databases and added new provincial and national species records for Canada. Our results demonstrate the value of combining molecular and morphological data in a standardized workflow and underscore the importance of improving reference databases for effective biodiversity assessments of dark taxa like microhymenoptera.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,002
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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